EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-09121 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr15:40691092-40692452 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr15:40692112-40692123TTAATTAATAT-6.62
NFYAMA0060.3chr15:40691280-40691291TCTGATTGGTC-6.14
Rhox11MA0629.1chr15:40691448-40691465TCCTTTAACAGCGTCTG-6.26
Enhancer Sequence
GGTCCAGAAT GTAATTTTAA GGCTTGGTTG TGTTTATAAG ATGCAAAGCA ATGTGTGCTT 60
ATGTTTCACT TGAAGGAAAT CGCGTAATTT TTTCATATAT CTCACTTTGA TTATACACAG 120
CTACTCAGCT AACATGAAAA CGACTGTCAT ATTTCCTAGT TCCTCTAAAA GGCCCGCCCT 180
TAAGTGACTC TGATTGGTCA TCGACATAAT GTGCTGCTAT TGGCGGATCG GCTCCACGTC 240
ACGCCCGTAA AAGCACACGC TTTTCTGCTG TGTAAACATG CAGTCAACCT CGCGCCCGCT 300
CTCTAAAATA ACATCTGACA AGTGTCTGTA ACTAACGAGT GAAAAAGGGG TGCGGCTCCT 360
TTAACAGCGT CTGTGTGTGC GTCTATGTGT GTGTGTGTGT GGTGTGAACT TTCTGTAACA 420
AGCGCTTTTC ACTGATGCTC GGATTAAGTT ATTTTCTGTA ATATATCGTG ACAGAAGAAT 480
AAAGCACAAG ATGTGAGATG CTACCTGTTG AGCCTTGGTT TATTATTCTG CTGCGACCAC 540
TAGTCAGGTA AGCTAATCTG TGTTTTTTAA CTCTATGCGT TATGACGTCT TTCACGAGTA 600
TCCGGAATAT GCAGGTGTAA GTAATATAAA TCATCCACAT ATCTTTTGCG ACTTCATTAT 660
CTGAGATGTG AAACACATGA AAAAGCCCAG ACAATCAGTG CAGTCGCGCG CGCACACATA 720
AGAGATCGTG CTGGTGGAGT GAGTGTGTGT TTACAGGAGT TTGGCTGATA AATGTGAGTT 780
TGTAGCTAAA TCGTTTGCCC GCAAAGCAGC ATTTCGCATT GTTTACATCA TTGCTACAGC 840
ATACAGTTAA CGCTAGACAC TGTACATGTC ATGATCAATT TTAAAAAATA AAAACACTTA 900
CTTGTAGATC ACAACTTCTG CTTTGAGGAG ATTTTAGCCG AATCCAGCAC TGAACTGGGA 960
GAGATTCTGG AGCTGTTTTG TCAAATCATG CTTGCTGAGT ATTTTATAAT TCTCTGGAAG 1020
TTAATTAATA TTGAACTAAA GGCACTTCTG TCTTTGTGTT GTGTCCTTTG GAAGCCCAAA 1080
TACAGAAACA GACGAAGCTC TGTGGAAACA GCCGTGTTTA GATGCATTTT TAGCTTCATC 1140
TCTGCTATAA CGTTACAGCA CCTCTGGCCA CGGCCCTTAC CTGCATGCGC AGTGTGGGAT 1200
GCGCAGTAAA CGAACTTGTG ATGTCACAGG GGGCGGAAGT ATTTTTTTGT AGTCCCCAAA 1260
ATTCGTTCAT TGTAGGCTTT GCTAAGCTAA CTCTGTGAAA ACCAAGGTCT CCCTTAGCAT 1320
TGAACTTAGA ACTTTTTACA TTCAGAGATG CTGTTTATTT 1360