EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-09098 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr15:39400631-39401759 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE40MA0464.2chr15:39400644-39400654ATCACGTGAC+6.02
Foxj3MA0851.1chr15:39400904-39400921TTGTTTGTTTATTTTCT-6.9
SREBF2(var.2)MA0828.1chr15:39400644-39400654ATCACGTGAC+6.02
Srebf1(var.2)MA0829.1chr15:39400644-39400654ATCACGTGAC+6.02
TFEBMA0692.1chr15:39400644-39400654ATCACGTGAC+6.02
TP63MA0525.2chr15:39401154-39401172GACGTGTCACAAGTTGTC-6.18
Enhancer Sequence
CACATCTTCG TATATCACGT GACCGACTTG AACCTTTGAG AAAAGTTCAA ACAAGATGGC 60
GGTGTTTAAG CGGCAGTGGA TCGAGGTCTC ACCTGGATGA TCTTTGATGT TGTATCACCA 120
TGTTTGGAGG CTTAATTGGA GTTTTAATCC ATCGATTTTA CGAGGAACAT TTGAAACAAC 180
AGAAAAAAGT CGCAAGTCGT CTTTTAGAGA AAACAGGTAA GCACGCTTTA TGTTCAGCTA 240
ACATTAGTCT ATCAGCACGC ACTGATATCC TTGTTGTTTG TTTATTTTCT ACGAGTTGTC 300
TCAATTATCT ACAATAGTTA ACAGAGGTAT GGTTGGTTTT ATTTTTACAC GTTATTTCTC 360
CTTAATATAA TTTCTTTGCT ATTTCTAAAT GGGGAAATCA TATTAGCACA ATGACTGTAA 420
AAGTATTGTT TACAGTCATT CAAATAGTGC TAATGTTGTT TTAAGTCATA CGTGTATGTG 480
ATTTCAGATC GAATTTTTAA AGTACCGTGG TAAACAATAT AGGGACGTGT CACAAGTTGT 540
CACTGAAGGA ATTTGCGAAT ATATATCAAC TTTACCTCAA TCAAAAGTGC CTTTCAAAAC 600
GCGCGCGTCG TCTCGAGCTG AGGCAATCCC GCGTCATCTC ACCCGGATCC CGCCTAAAAC 660
CAGAAACCTT TCAGAGCTGG AGATAAAAGG TGACATTGAG GGGGTTACAG CATCCAAGTC 720
ATCCTTTTCA CTGCTTCTAT GTCTTGAGGA CAGACAGGGA AATGTCAATG TGAGCAGCAC 780
GAGCTGGAAG TTGAAACGGA AGAGAGCATC ACGACATCTC TCTCATCAAT TTTACCCGCC 840
AGACAGGTAG AAAAAAACTT CACATTCCCG TCTTGCGTGT CAGGTAAATT CTCTGATTTA 900
GGGACGCATG GTAGTGGAGG TTATTTTTAA TAATTTGAGT GGCACCTGAG CGTGTGACTC 960
TGATGTGTTT TTTTGCGTGA AGACGGCTGA AGTTATTAGA CATGGCGCTT TCGATGTAGC 1020
GTCTCACTGA AGCAGCAAAT TAACACAAAG ACACGGCGAC ACATTAAGAA AGAGGGATAG 1080
AGAGAGGAGA AGAAATATCC GTTTCCTCTT GTATCCTTTC CTCACTCC 1128