EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-09037 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr15:36490390-36490979 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr15:36490956-36490973CCAATTAATTAATTTTT+6.1
Alx1MA0854.1chr15:36490924-36490941TGCATTAATTAATTAAG+6.32
Alx4MA0853.1chr15:36490924-36490941TGCATTAATTAATTAAG+6.22
ArxMA0874.1chr15:36490923-36490940TTGCATTAATTAATTAA+6.34
ArxMA0874.1chr15:36490924-36490941TGCATTAATTAATTAAG-7.06
IRF1MA0050.2chr15:36490703-36490724AAAGCGAAAGTGAAAGTGATA-9.74
IRF2MA0051.1chr15:36490707-36490725CGAAAGTGAAAGTGATAG+6.75
IRF3MA1418.1chr15:36490700-36490721TTAAAAGCGAAAGTGAAAGTG+6.11
IRF7MA0772.1chr15:36490706-36490720GCGAAAGTGAAAGT+6.57
Lhx3MA0135.1chr15:36490926-36490939CATTAATTAATTA-6.46
Lhx3MA0135.1chr15:36490958-36490971AATTAATTAATTT-6.92
POU6F1MA0628.1chr15:36490927-36490937ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr15:36490959-36490969ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr15:36490927-36490937ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr15:36490959-36490969ATTAATTAAT-6.02
PRDM1MA0508.2chr15:36490712-36490722GTGAAAGTGA-6.02
Enhancer Sequence
CAGGATCCCA TTTTTAGGAT CGCATCTTTA GGACCCTAGT TTTTTTTGTG ACAGCGTCAT 60
CTGTCGGATT GGATCATGTA TGCGCTAATG GACGACACGG ATGACAAGGA AAGTGTACCG 120
ATTTTCTATT AAGTTTTGTT TAAAACTTTT AAAGTTACGT TTGAGAAAAC ATGGGCATTA 180
GACTAATCAA CTGAATTACA AACACGGTTA TCAACAAAAA TGTTTTACAC AGTTAACGAT 240
GCCATATGTA GTATGTACTG TGAACAAATA TCAAGCAAAA TAACCTACCA GTTACCAGTC 300
TTTCAAGTGT TTAAAAGCGA AAGTGAAAGT GATAGGCTAC AAAGCTGACA CAAAGCAACG 360
ACAGATTATT TAAGATTATT AAATTGTAGG TATTGTGTCC AAATCTTGCT CTTTCAACAC 420
CGAAATGCTT TCTGAGTTTA AAAACGAGGG TTTCCTCACG TTATCAATAG GAGTAAGCTA 480
TTCATTAAGG AAATAAATAA TGTATTTGCA ACCTTTTAGT TAAAGTGAAA TGGTTGCATT 540
AATTAATTAA GTTTAATTTT TCCTCACCAA TTAATTAATT TTTACTTTG 589