EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-08883 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr15:30087988-30089107 
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr15:30088807-30088826TTGCCAGTAGGGGGCATAG+6.12
Lhx3MA0135.1chr15:30088667-30088680ATTTAATTAATTT-6.07
Enhancer Sequence
CACACACACG TTATACAAGT TCATTTAAGA TTATTTATTG GTCACAATTT CAGTTATTGT 60
GTTTATACAT TTCGTTTCAT TCATATCTGA TTTAAATAAG ACGCATACAC TTTTTCAGTT 120
ACTCATTACC TTTCTTTATT ATTCACAGTA CATTTATTAC TATTTTGGGT GCACACAAAA 180
TCAGTTATCT GTACTGTATG TTTTGTTAAT TTAGTTTTCT TTTGAGTTTA AGTTACCATG 240
CTGCAGTGCC GACGAGGAAC AGAGTTTCCG GGTGTGGTCC GCCCAAGTAA AGGTCCGACG 300
TGCCGCAAGA TGCCGTCTTT TGGTTCCGCC TGCCGATACC ATTGGCTTAA TGGCTTGGAG 360
GGAGAGCTCA TGTTTAGTTT AGGTTCAATA ATGATTTGCA ATGTTTGTTT ATTCAGATTT 420
ATATTTAGTT TTGCCTTATA TAGAAGTTAT TTAACTTATA TTTAGATTTG TATTTAGATG 480
TTAGGCTTAG TTTATTGTAG TTGTAAATTG TATGTTTTTG TCTCCCCCTT CTTGTTTAAT 540
GTGGACTAGT CTCTGTGCTA TAAATGTGGT CTGTCTTGTC ATTTCATGGA GTTCTGTTTT 600
TGGTTTAGAC ATGATTTGTT TGGTTTGAAC TCAGTTTGTT TTCCTTGTTT AGTTTATTGT 660
TCTTTCAATT GATTTAATTA TTTAATTAAT TTATTTTTGA ACTTTTTGTG AACCTTTTTG 720
ACTTTATTAA AAATAATTAT TTTTGAAAAT CTTCTTTTTT GTATGCCCCT TACTGTACGT 780
GCTGGCTCGG TCCCTCACAA GTGGTGTCAG AAGTGGGATT TGCCAGTAGG GGGCATAGTT 840
TTTTTTTCTT TGGTGAACTT TCTGGGCCAT GAACCGAGGA GGACGAAGAG GAGCCCCAAA 900
GGCTGTTTCA GTGGAGCAAC TGGATGAAGT TGCACAAGAG CTTGGGGATG AAGAATTACA 960
GGAGGTGAGA GAATTTGATG TGGAGACTGA ATGCACTGAA CCAACAATAG CTGACTTGAC 1020
AGGCTTGTTG AGAGCTCACA TGGTAAAAAT GGAGGCTCAG GAAGCACAAA GGATGGCAGA 1080
GCTGGCCCAG CAGGAACGCC GATTCAAAGC TCTCCATCA 1119