EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-08500 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr15:16585337-16586463 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LHX2MA0700.1chr15:16585641-16585651ACTAATTAAC+6.02
SOX21MA0866.1chr15:16585491-16585506AACAATGTTATTTTT+6.1
Sox1MA0870.1chr15:16585491-16585506AACAATGTTATTTTT-6.28
Enhancer Sequence
TTTAGGTGTG GTAAGACTCT GGTCCATTGA ATTATTAGGT GAATTGGAGA GGTGTAATGG 60
TCATGCTGCA TAATTTTGGA ATAACTTTAT GTCCTATATT GTCATTTAGC TATTCATTGC 120
TCAAAATCCT GTACAGGCTA TCAGTATACG TAACAACAAT GTTATTTTTT CGTGAGTTAT 180
TATCAGCGTA TTGCTGTGTA TGTAAATACG CTCAGTAATT CCTCTAGTTC AAAAAGATAC 240
ATTGAGATTC TCCCAGGAGA TCTCCATTTA GCGCATCTGC CCTAAAGTGT GCCTCCAGCA 300
TCTTACTAAT TAACGTTGGA TGTACCATTC ATTAATCTCA TATTATATTA AGCCCAGAAA 360
TTCTGTACCT TCTTCCCTGG CTTTGTAAAA TGATGTGGGT GAAGAGTGAT CAAGTGCGCG 420
CGTGAGCAGT TCTTCAATCC CACACACGCG CGCGCATCTG CTCCTCCACT CCGCGTTTTC 480
CAGCCGGCTC AGCAGAGGCG CTATCCAGCA TTATGAGGAC AAAACCATTT AACAGGGCAC 540
ATTAACTGCA GAGAACTGTG TGAACGGAAC GAGACGCAGG CTACTCGTAG ATCAACGGCT 600
GACGTCTGAA ATAACAGCAG ATCGGAAATA TAGCGACTAT AATGAACGGT GCGCTGGATG 660
TGGACGAATC CGGCTGGAGA TGATGATGAT GATGGTGATG ATGATGTTGC GTCTGCGGAG 720
ACTCAGAGCT GAAGTAGAGG GATCTTACAC ACTTCTTCAA GCACACACGT AAAGCCTGAC 780
CTCTCGAAAC ATCTCACATT ATTTATTTCC AGGAAGGAGC CGTGTTTGTC ACTGAAGACC 840
TCCTGAATTT GACTGACAGA CGCCTTATGA TGAATGACTG CAGTTTATGA CCGTTTGCTG 900
CGACTCTTTG AAGTATGTTA ATATATTTCC CATGTGGGTT TCATACAGAA GAACATGTGA 960
ATACGGATGA AAGCACACAG GCGGACTCCA CTATGTTCAA GAGCAGGATG CGTTTTACCA 1020
ATCCGAAATG GTAAGTGCTT ATAATACATT TCTGAAATGT ATTATAAAAT GAAATGTATT 1080
TCTGAAGTAT ATTTCAGAAA AGTCTTGCAG GAACAGTTCT TATTGG 1126