EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-08023 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr15:3718031-3718760 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GSX1MA0892.1chr15:3718703-3718713CCTAATTAAA+6.02
NFYAMA0060.3chr15:3718532-3718543AGCCAATCAGA+6.32
NFYBMA0502.1chr15:3718527-3718542CAATTAGCCAATCAG+6.64
Sox1MA0870.1chr15:3718587-3718602AACAATCTTATTGTA-6.18
Enhancer Sequence
ACATTTTAAC TAATTTGGCA GTTTGCTTAG GGTCATGGTC TGTTTGGAAG ACCCATTTGT 60
GGCCAAGTTT TAATTTCCTG GCTGGTGTCT TGAGATGTTG CTTCAGTATT TCTTCATAAT 120
GTTCTTTCTT CATGATGCCA TCTATGCTGT GAAGTGGACC AGTCCCTCCT GCAGCAAAAC 180
AGCCCCACAT CATGATGCTG CCGCCCCCAT ACTTCACAGT TGGGATGGTG TTCCTTGGCT 240
TGCAAGCTTT CCCTTTGTCC TCCAAGTGTA ACACTGCTCA TTATGGCCAA ACAGTTCAAT 300
CTTAGTTCCA TCAGAGCACA GGACATGTCT CCAGAAATGA GTCTTTTTCC CAGTGTAATT 360
TAGCTAATTG TAATCTGGCT TTGTTGTTGA TTCTGGCTTG TTGATTTTCC CATGTTGTCA 420
CACAAGGAAG CAGTGTGTTT GAGATTTTCC TTAAATACTG TTCTACAGTT GTGCCTCCAA 480
TGAACTCAAA TGTTGTCAAT TAGCCAATCA GACACTTCCA AAACCTTGAC ACCATCATCT 540
GAGCTTTCAG AGGCAGAACA ATCTTATTGT ATGTAAACTT GACTTTCAAG AAACGTTATA 600
ACAATTTCTC AAAAAATCTC TATCTCTTTA TTTTGCTATT AAGCAGAACA GAAACAAATG 660
TGATCATCCT AACCTAATTA AAAGAGAAAA CGTTTAGCCA CATTAACATC TGACTTTTTT 720
GAAATGGTG 729