EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-07611 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr14:40403625-40405123 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr14:40403959-40403975CCTTGTTTACATAAGA-6.44
FOXD2MA0847.2chr14:40403961-40403974TTGTTTACATAAG-6.71
FOXK1MA0852.2chr14:40403958-40403972CCCTTGTTTACATA-7.64
FOXK2MA1103.1chr14:40403960-40403971CTTGTTTACAT-6.62
RARA(var.2)MA0730.1chr14:40404954-40404971AGTTCAAAAAAGGGTCA+6.21
RORA(var.2)MA0072.1chr14:40404933-40404947AAAAAGTAGGTCAT+6.17
RORCMA1151.1chr14:40404934-40404946AAAAGTAGGTCA+6.32
Rarb(var.2)MA0858.1chr14:40404954-40404971AGTTCAAAAAAGGGTCA+6.2
ZNF384MA1125.1chr14:40405074-40405086TTTTTTTTTATT-6.62
Enhancer Sequence
TCCAGCTTAA GCTGATAGGT TTTCTATGTT TGAAATCTCC CAATTCACTG TTACCCTCTG 60
AAATCATTTT AAAACCGAGA TAATCACACG TTTTGATTTA AAAACCCCAT GATGAGCAGG 120
TTTAGCATTC TGTATTTGAT GTAATTACTA GCAGAATTAT GGAAATATTA CAAACACTGA 180
TCTCAAGTCA TCACTGATCT CCTCTTTATT ACACTAATAC TTATAGTCGG AGCATAAATA 240
TGCAATAGGT GCATTTATAC AACCCAACAT ATAAATAAAC TCATGCTAAA TTTCCAGATT 300
GAAATTGCAA GAGAGTCCTG ACGATGCACA AAACCCTTGT TTACATAAGA AGTTCTCTTG 360
TTTTGACATC AACAGGCCTG CACATGAGAC AAGCGCACAC TGAATGAGCT GTCAGAATGT 420
TGGTAAGTGT GTTTACATAC ATATTAAAAC TGAGGTAATG TGTAAATAAT CTAGTTTTAC 480
CTGTTTTTTC TTACTTTGCT TTAACCTTTA GCAGGTTATA ACCCATGATG TTGTCTAGTT 540
AATAAGATAA AGTGAGTAGG ATGACTGTGT AGATCTGAAT CTAATACACA ACTGCTGTTG 600
CGTGCAGAAG CTGAACTCCG ACACGGCGGC TTAATATCAT TTCACTCCCA TTACAAGACG 660
ACTTGACTTA CGGGCTAATT ATTGACTCTG CAAAGTCCAG CATGGCTAAT CATTATGATC 720
CAGAGAAGCA GAAAGATACA TTTCACTGCA CTTGTGCATG GAAAAGCCAA CAGACACTGA 780
GAAGCGGTGA GGCTGGTCTC CATGAAAGCA TTTCTATTGT TAGTAGTGGG CGGCAGAAGA 840
CATCTGAGAC TGTGGGGTGA CTGGTGGAGT GTATTTCTGA TGGTTTAGTG ATAGAGTGGG 900
GGGATTTAGG GAGTGACTGA GAAACAATAA TAGATTTCTG GGAGGAACGC CACTCTTCTT 960
CTAAATCGCA ACAAGTTGGG CAGGTTGGGC CTGAATTTGG TTTTCAGTTC TCTTTCAGTT 1020
TGCGAGTGAA GAGGCATGGG ATAGGATAGA AGACCTGTCA CACTTGATTC ATGCACACGA 1080
CTGCACAAAC ACACACTTAA GATTGAGATC AACACTCAGA AGTCATCTGA ACTCAGACAG 1140
AACAAACTAA AATACATGAG CGCGACAGCA TGGCATACAC ACATGCAGTG GAGTGAAAAA 1200
TAGTTAAGCC ACAATTCAAA ATGTTGATTT ATACAAAGAA ATATGGAACC AGGTTTTATT 1260
TATTACTGAA GGAAGAATTT GCAAAAGCAT GCGTCAATTA AAAACACAAA AAAGTAGGTC 1320
ATTTTGTTAA GTTCAAAAAA GGGTCAGTAA AACAGCAATA CTTTGATTCA GAAAGGACAC 1380
ACTAAATTGA ATAAAAGTGC CAGTAAAGAT ATTTATAATG CCACAAAACA TTACTATTTC 1440
AAATAAATAT TTTTTTTTAT TCATTAAAGA TTAAAAATGA TTAAAGTGCA CCACATTT 1498