EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-07522 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr14:34625920-34627404 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr14:34626483-34626495GAATGTTTATTT+6.74
HOXD9MA0913.2chr14:34626691-34626701GTTTTATTGC-6.02
RFX1MA0509.2chr14:34627159-34627175GGTAGCCATAGCAACA+6.54
RFX1MA0509.2chr14:34627159-34627175GGTAGCCATAGCAACA-6.54
RFX2MA0600.2chr14:34627159-34627175GGTAGCCATAGCAACA-6.68
RFX2MA0600.2chr14:34627159-34627175GGTAGCCATAGCAACA+6.79
RFX3MA0798.1chr14:34627159-34627175GGTAGCCATAGCAACA-6.67
RFX3MA0798.1chr14:34627159-34627175GGTAGCCATAGCAACA+6.8
RFX4MA0799.1chr14:34627159-34627175GGTAGCCATAGCAACA+6.41
RFX4MA0799.1chr14:34627159-34627175GGTAGCCATAGCAACA-6.96
RFX5MA0510.2chr14:34627159-34627175GGTAGCCATAGCAACA+6.17
RFX5MA0510.2chr14:34627159-34627175GGTAGCCATAGCAACA-6.34
Rarg(var.2)MA0860.1chr14:34626561-34626578GAGGTCACTACAGTTCA+6.31
Enhancer Sequence
TGTAATGTTT CTGGAAAATG TTATTTTAAT AATTGTTATT ATATACCGTT TTAGCCTATA 60
GAAATCGCAA TGTAGCGGGA GTGGAAAAGA AATATTATCA AAGTAAAGAG CCACCATTAC 120
AGACACTAAT AATTAAAATC CCTTATCGTT TTTCTATTAT CCACAGCTCG TGATCTTCAT 180
TATAGCGCAT TTAATCTTTA TCGCACAGTA GGCAACGTGA ATGCTGAGTC GTCTGGTGTG 240
ACTCTTATCA TTTCACCTAT ATCCACCCCC TCTCCTCCTC TCTCGCTTTC AGTCTCTGTG 300
CCCTCATGAT GCCACGGCGC TCGCTAATCC GCTCTCCGCG GTGCACATGC TCAGTACCGA 360
TCACTGTGGC GATCTGTAAT GGCTGCGGGA TGATGTGATA CGAGTCCCGG TGCCGAGCCG 420
CGTCTCTTCG GTAGGAATGC CTTTTCCTTG AGACCGCCAA CCACTCCGTT CATTCCTCCG 480
TCAACATGGT TGGCATCCGA CAGAAGAATA ATCGTCGGAC ATCGTAGTCT CGTGCACGTG 540
CGAGGGCGAT ATTCGTGTAA GTTGAATGTT TATTTTGTGT CTGTAAATTG CGATTCATTG 600
AGCGGGGGAT CCGGACATGC GTGTGTCAGT GTTTGTTATC CGAGGTCACT ACAGTTCAAA 660
GCAGCATCTC TAGAGAGACA AGACACGCAT ATAGACGCGT GCTGCATAGA GCTGCATTTA 720
GACATTATAA ATAACGTTAG CGTGTTTTGA TTCCATTTCA GTGCATGTTG CGTTTTATTG 780
CAAACGTTTA ACACCGGTTA TCACAACGTG CTAAAGCAGC GTCGCGTTGG TATCTTTAAC 840
GATAACCTAA TACATCTGTT TCTTACGTGG GTTGTTCTTA TGTATATTAA TAGGAGTAAA 900
ACAGAAGTTA TTTGTGTAGA TGCGCTTATT TAGCACCGCA ACAGGCTCAC TGTGCGACCA 960
GCCAGTCACA CACAATGAAT TTTCAATGAG CTCGGGGGTT ACTACAGTTC ATTTCGACAG 1020
TTCCTGCTGC CTCCAACACT AAAATGCATT ATCAGATGTC GTGGTGTGGT GCGGGCGGTC 1080
AGAAATGCTT CCTAAAACGG TTAAAGTCTT TTAAAAGGAT ACCAAAAACA GCAAGATGAG 1140
AAAAGGTAGA TTTTGAAGCA ACGTTTTAAT GGTTTTGAAA TGTGTCAATC TTCATAGAAG 1200
TTATTAAGAC TGGCAACAGA AATGTGTTCT CCTTTACGGG GTAGCCATAG CAACAGTAGG 1260
CCGCATGAGG GGTTTTCGTA AATTGTCTAA ATACTAAATG CTATATTTAT GTCTTCATTG 1320
AATACACAGT ATTTATTAAA GTGTATTTGC ACATAAAAAG TGTCAAGAAA ATGTGTTTTT 1380
TGCTGGTTTA AGCTGGAAGT TACTTGTTTT AGCTGGTTTT CAAGCTTGGC TAAGCTGTTT 1440
CAACTGGTTT TCCACTCAGT CCATATTGTA CAGTTAGTAA GACC 1484