EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-07406 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr14:30421407-30422393 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr14:30421466-30421478TTTGTTTATTTA-6.18
RFX2MA0600.2chr14:30421792-30421808GGTTGCCAAGGAAACG+6.12
RFX2MA0600.2chr14:30421792-30421808GGTTGCCAAGGAAACG-6.12
RFX3MA0798.1chr14:30421792-30421808GGTTGCCAAGGAAACG-6.38
RFX3MA0798.1chr14:30421792-30421808GGTTGCCAAGGAAACG+6.51
RFX4MA0799.1chr14:30421792-30421808GGTTGCCAAGGAAACG-6.19
RFX5MA0510.2chr14:30421792-30421808GGTTGCCAAGGAAACG+6.28
RFX5MA0510.2chr14:30421792-30421808GGTTGCCAAGGAAACG-6.63
ZNF24MA1124.1chr14:30421436-30421449AAATGAATGAATG-7.34
Enhancer Sequence
TGATTATTAA AGGGATTAAG CCAAAAAGAA AATGAATGAA TGATTTATGC AGATATTTAT 60
TTGTTTATTT ATGTATATGC GTATTTATTT ATATATTGTT TTATTTATGC AAGAATTTGT 120
GGATTTAGTT ATTAAATTAT ATATTTATTT ATCTAGATTT CGTCCTCCAT ATTAAACAGT 180
TTTAAATGTT AAAATGTCTA TGCTAAGGAG AAGAGGACCG ACTGTTACAG CTGAAATATT 240
TAAAAGTAAG CTATTCCGTT TTGCGTTTAG CTGCTAGCAT GTTGTAAAAA CAAAAGATAA 300
ACAGACCATG CTTTTTTTCC AGCAGATATA TCGTGGCCCT TTAAGGAGGG GTCGTAGAGG 360
CGCGCCGGCT GCAAAGCGTC CTTCTGGTTG CCAAGGAAAC GTGAGAAAGG ACAGAACGCA 420
GACAGGACGG GAAAGTGAGA GACATATCAG CTCCTGTTAC AGATTTTTTA ACACGCTGAC 480
AGAAACTTTA AACTTACAAG AGAGCAGAAT AAGAGGTCGA ATGCAATAAA TTCACAGCTG 540
TTTGTTTTGG TAAGTTTTTC GCTCCTCTGT CTCTTTTGTA TTGGCTTCAC GCGAGCATGA 600
ATGCTTGGGT AATTATTCGA AATGTAACTT AATATTCTTG CGCCATTTTC TCAGGTGTAT 660
GAGACCATGT GCCTTGTCTT TCCGTGTTTG TCATGTACTG GAGTAGTCGA ATTGCTTTTT 720
AAAAATGATA TCTTAAGCAG TCTGCTCATA TTTTGCTTTA ATTTGCTGCT AGCTGTCCAT 780
CAAACCTGTG TTTGTTCAGC ACCAGTTGAA TGGTGCGTTA TTTTTTGCTT GACTACCTTT 840
GCTCAATCAT TTACTTATGC ACTCAGGACT AAAAACGTAA TTGTATTTGT ATTGAAGGAC 900
ACTCACTTCA GGGTTTAATA CTTTGTGTTC TTTTTATTAT TAAATTATTA TTTTTTAAAT 960
ATAATTCATG CAATACTTGC ATTTGA 986