EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-06883 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr14:9150312-9151354 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ATOH1(var.2)MA1467.1chr14:9150649-9150659GACAGCTGTT-6.02
Arid5aMA0602.1chr14:9150985-9150999GTAATATTGATATT+6.13
LMX1BMA0703.2chr14:9151252-9151263TTAATTAAATC-6.02
Enhancer Sequence
ATCTAGTTGT TATATAATTG AATAGTAAGC AAAAGCACCA ATTGTCATTG GAAAAAAAAT 60
AAGTTAGTAT TATTTGATGT TGTATGATTA TATTCAGTTA AACTATTATT ATTTATCTTT 120
TTATAAAGTT GAATATAAGA TATGTCTTAA TTTTATAATA ACAGTTTTTT AACTCAATGA 180
CTTCACTCAG CTGTTTACAA TGCAAAAATG AGGATGTCTT AAGTTTATAT TTAATCTATA 240
GAAATAATAA GCCCGTTAAA TACAATTAGG TTACTGCACC TTTAATCTTT CCATCTCTGC 300
AAAAGTGAAA GACCTTCTCC AAACAGAGTC ATAGACAGAC AGCTGTTCCA GACTCCAGTA 360
GACAAAAAAG CTATTCGCTG TCATCTGCCT TTAAATATGT AGCGGACTGC AGCTCTTCAG 420
TCCAGCTGCT GATGCTGCTG CTGTTTCGTC CTCAATGCCA TGCTGAAAAC ATCCGACAAC 480
AAGCTTTTCT CCTGATCGTT AAAAGCTTCG GTGAGTCCCT CAGAATTATG CCATTATTAA 540
TGTTGATGTT TTCCAACAGT TTTACTGCAT GTGGTCGGTG ACTTTACTTC ATTTTAAAGG 600
TTATTAGGCC TAGGAAATGT AGCGTGGTAT GAAAGACACT TGGGTTAAAT GACACCGCGA 660
TTGCACCGTA CAAGTAATAT TGATATTAAC AAACGAGGAA TGTTGCAGTG ATTGTGTTAC 720
GGGATGAATC GAGCGCACCA GCAGCAGTTC ACACAGGATT CATTCTTACG TTTACCTCGA 780
GGGACCCAAC GGAATGCAAC TCTTGCCTGA ACTATTTTTA ACTTGGCACG AGTCTGGAAA 840
TGAGCGTAGA CAAAAGCATC TCTATGTGGG AACCAGCAAA GGATCACAAA GCGCAGAATG 900
CGTTTTTATG GCGTGACAGA AGTAGACTCG ATGGCATTTT TTAATTAAAT CATAGACAGC 960
AAAGTCTATG AAGGTGGGAC GTGCTCTCAA GTCATAATAA ACATTGTAAA GTACTTTGAG 1020
TTTATTTCTG TTTTTGTTTT TA 1042