EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-06727 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr14:2460564-2462202 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr14:2462012-2462029GAGAATTAATTAGTACA-6.1
Arid3bMA0601.1chr14:2460860-2460871CTAATTAATAT-6.02
Arid3bMA0601.1chr14:2461351-2461362CTAATTAATAT-6.02
FOXA1MA0148.4chr14:2461826-2461842GTTTGTTTAGTTAATG-6.29
GATA6MA1104.1chr14:2461998-2462011TAAAGATAAGAGA+6.28
JUN(var.2)MA0489.1chr14:2461941-2461955CTGAGTCATTTTTT-6.45
LMX1BMA0703.2chr14:2461791-2461802TTAATTAAAAT-6.62
POU1F1MA0784.1chr14:2460634-2460648CTAATTTGAATATT-6.48
POU1F1MA0784.1chr14:2461172-2461186CTAATTTGAATATT-6.48
POU1F1MA0784.1chr14:2461887-2461901CTCATTAGCATATG-6.52
POU2F1MA0785.1chr14:2460789-2460801AATATGCAAATA+6.37
POU2F2MA0507.1chr14:2460790-2460803ATATGCAAATATA-6.3
POU3F2MA0787.1chr14:2461888-2461900TCATTAGCATAT-6.27
POU3F3MA0788.1chr14:2460789-2460802AATATGCAAATAT+6.05
POU5F1MA1115.1chr14:2460790-2460801ATATGCAAATA+6.02
mix-aMA0621.1chr14:2462015-2462026AATTAATTAGT+6.62
Enhancer Sequence
TTTAACATTC GCACATTCCT TCATTTTCGA ACAAGACAAC TTGTGTCCCT ATATTGTTTG 60
ATGCACCATG CTAATTTGAA TATTCAGCTT GAAATCGCAT GTAAGTATGA CTTCAAAACA 120
ACATTAGCAC TATTTAATTG ACTCTAAACA ACTTTGATAG TCATTGATTT ACATTGAATT 180
TGAAAATAAT ACTTTGCTGC AGCCTACTAT TAAGGAGAAC GTCTGAATAT GCAAATATAA 240
AACAACTTTA CCTCAATTCC CCTCAGAACT GCTGGGCTCA TGTCAGTCAA AGCCACCTAA 300
TTAATATTCA TGAGCAAAGT TCTCAAGTTT CCATGGTGAG ATTATTCACA ATCTGAAAGC 360
GTGTCATAGC ATTAAACCGC CCCGTAGCGT TAGTTTTAAA GACGAAATGC AGTCATACGT 420
ACCTCTGGCT ACATAATTTG CGCTCTCCAG AAACATAGAC AGGTGTACAT ATTCACAATG 480
AGCCTGCAAA GTTACTTTCC ATTCCATTCC CACTGACAGA TTGAGGTAAA GTTGGTTTAA 540
TATTCGCACA TACCTTCATT TTCGAACAAC AAGACAACTT GTGTCCCTAT ATTGTTTGAT 600
GCACCACGCT AATTTGAATA TTCAGCTTAA AACAACATTA GCACTATTTA ATTAACTCTG 660
AACAACTTTG ATGGTCATTG ATTTACATTG AATTACAAAA ATAATACTTT GCTGCAGTCT 720
ATTATTAATA AGAAAGTCCT CAATTCGCCT CAGATTGAAC TGCTGGGTGC ATGTCTGTCA 780
AAGCCTCCTA ATTAATATTC ATGAGCAAAG TTCTCAAGTT TCCATGGCGA GATAGTTCCC 840
ACTTCTGAAA GCGTGTCATT GTTTGAACGT GACTCTGCGC TGTAAAGCTG CTCTCCTCTA 900
ATTCCTGATC TGTAGTCTGG AGAGGGACAT GTCTAAATTG CTCATCTCCT CACCTCCGGT 960
TCACGGGCCC TCAGAGAGAT GAACTTCGAT TTAGAGAAGT GTGTTAGCGC CATGGAGACC 1020
GTTTCTTCAT TAACGTTTGT AATCTGAAAG GACACACGGC AAAACCTAAT TACCCCTCTC 1080
AACTGGGCGA TACTCATCTA TTGACATTCT GAACTCATTT CCCCGGGAAA TTAAAATGGA 1140
AAGGGCGCGC GAGAGATTGC GTCCAGGTGT GGCATTTTCA GGGGGAGCCC GATATTCCCC 1200
CTGTGGGCCC GTCTGTTTTC CCCGTCTTTA ATTAAAATGA TATTTAGACG ACGGAGTTTT 1260
GTGTTTGTTT AGTTAATGAA CCAAGTCTAT TCTCCGTGGG AGGAAAGAGG GAATATAAGA 1320
AAGCTCATTA GCATATGTTA GCATTTGCGA TGTTTACTCG GTGCGTGCAA GAGTGGCCTG 1380
AGTCATTTTT TTCTCCTCCT TTGTGCCGAG AAATGTCTTT CGCAGGCGAC TATGTAAAGA 1440
TAAGAGACGA GAATTAATTA GTACAACACA GAGGTATTCG GTTTGCAGTC CAACAATTGG 1500
CATTGCTGCA ATATTATGGG CTACTTTGGG AATTTCGGAT GGGTTGTAGA TTTTTAACAG 1560
GTTTATTTCT AGAACATAAA TATAATAAAC ATCATATCTG AATTATAGGG GGATTGTTGA 1620
CAACTTGATG CAACTTAA 1638