EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-06628 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr14:557469-558464 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx4MA0853.1chr14:558314-558331CAGTGTTAATTAATACG-6.09
POU4F3MA0791.1chr14:557922-557938ATCATGAATAATTCAA-6.14
RARA(var.2)MA0730.1chr14:557884-557901AGGTCACCGTAAGCTCA+6.02
Rarb(var.2)MA0858.1chr14:557884-557901AGGTCACCGTAAGCTCA+6.56
Enhancer Sequence
AGGAGTTCAT GAGTAGTTAA GAATGGATTA ATGATGATGT GACCCTCCAA GTAAAGTCAC 60
AATATAATTA TACATTAAGA TATCATGAGT ACATGATGGT TAAATTAGGC ATAAACATGT 120
ACTAACAATT AAGGTAGCCG TTATTCACAC ATGAACTCGT GACTCATGCT GTAGTTAAAG 180
TTAATTCATG ATTGGCATGC ATTAACTCAT CATTAGTTCA TAATAAAGTA ATGTTTAGTT 240
AACATATTAA TACATCATTA TTCATGTACT GTTATTGTAA AGTGTTACCC ATGATGAACA 300
AGACATTAAG CAGCAGCAAA ACTCTGTTGC TTTGTATTTT GCTGCTTTCG GTTTGTATTT 360
CTTAACGCAC TTCCGCGTTC GTTACTCTCT CGTCATGATC TTGGATGATG AGGTAAGGTC 420
ACCGTAAGCT CAGCGTAGTG CTTCGGTCAC TGCATCATGA ATAATTCAAG TAAAACGTAG 480
CTGTGGTGTC ACGATGATTG TGTCTGTCGT AGCAGCTTGT AATCCTTCTC GTGAATATTA 540
ATGTGGTGAT GCGCTCAATC GTTTCGTTAC ACAATGGCTA CGTTGAGCCT ACGTCATCTG 600
CTCCACTTCC TTTAAAAGGA GCTCAACATA TTTGGCAGCA AGGAATAAAC TTATAAACCG 660
TCCTTTTTAA TACGAGCTCT GTTAAACCGT CATGAAATGT CCGCTATCCA TACTGTTCTC 720
TCATCATAAC TTTTTAGCTC TGAAAAAACG ATTTCTTGTC AAAATAAAAG TCCCTCATAA 780
ACAATAGAAA TAAAATTATC CTTCAGCATA AAGAAATGTA AGATAACGCT TATTTACGTC 840
TGTTACAGTG TTAATTAATA CGTTAGTTAA CAAATTAGTG CTTACAAGAA CCATTAATGA 900
ACAAATATTA CATTATAATG CTGGAGTTCA GACTATAATA AGGTTTATAA TTACACTAAC 960
AAATGCTTTG TTAATGGTAA ATCATATTAA TAAAT 995