EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-06516 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr13:49873643-49874807 
TF binding sites/motifs
Number: 35             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr13:49873772-49873791CAGCGACACCTGGTGGACT-6.09
ELK1MA0028.2chr13:49874150-49874160CACTTCCGGT-6.02
ELK4MA0076.2chr13:49874149-49874160CCACTTCCGGT+6.32
ERFMA0760.1chr13:49874150-49874160CACTTCCGGT-6.02
ERGMA0474.2chr13:49874150-49874160CACTTCCGGT-6.02
ETS1MA0098.3chr13:49874150-49874160CACTTCCGGT-6.02
ETV3MA0763.1chr13:49874150-49874160CACTTCCGGT-6.02
ETV5MA0765.1chr13:49874150-49874160CACTTCCGGT-6.02
FEVMA0156.2chr13:49874150-49874160CACTTCCGGT-6.02
FLI1MA0475.2chr13:49874150-49874160CACTTCCGGT-6.02
FOXK2MA1103.1chr13:49873954-49873965ATGTAAACAAA+6.32
FOXP2MA0593.1chr13:49873954-49873965ATGTAAACAAA+6.14
GabpaMA0062.2chr13:49874148-49874159GCCACTTCCGG-6.62
Hoxa11MA0911.1chr13:49874303-49874315AATTTAACGACC-6.32
NRF1MA0506.1chr13:49873739-49873750GCGCATGCGCA+6.32
NRF1MA0506.1chr13:49873738-49873749TGCGCATGCGC-6.32
POU1F1MA0784.1chr13:49874580-49874594AATATGCAAATAAA+6.34
POU1F1MA0784.1chr13:49874756-49874770AATATGCAAATAAA+6.34
POU1F1MA0784.1chr13:49874636-49874650AATATGCAAATTAA+7.47
POU2F1MA0785.1chr13:49874580-49874592AATATGCAAATA+6.37
POU2F1MA0785.1chr13:49874756-49874768AATATGCAAATA+6.37
POU2F1MA0785.1chr13:49874636-49874648AATATGCAAATT+7.22
POU2F2MA0507.1chr13:49874581-49874594ATATGCAAATAAA-6.98
POU2F2MA0507.1chr13:49874757-49874770ATATGCAAATAAA-6.98
POU2F2MA0507.1chr13:49874637-49874650ATATGCAAATTAA-7.34
POU3F1MA0786.1chr13:49874637-49874649ATATGCAAATTA+6.74
POU3F2MA0787.1chr13:49874637-49874649ATATGCAAATTA+6.74
POU3F3MA0788.1chr13:49874580-49874593AATATGCAAATAA+6.04
POU3F3MA0788.1chr13:49874756-49874769AATATGCAAATAA+6.04
POU3F3MA0788.1chr13:49874636-49874649AATATGCAAATTA+6.92
POU5F1MA1115.1chr13:49874581-49874592ATATGCAAATA+6.02
POU5F1MA1115.1chr13:49874757-49874768ATATGCAAATA+6.02
POU5F1MA1115.1chr13:49874637-49874648ATATGCAAATT+6.62
ZBTB7AMA0750.2chr13:49874148-49874161GCCACTTCCGGTT-6.33
mix-aMA0621.1chr13:49873827-49873838ACTAATTAATT-6.62
Enhancer Sequence
CCTTACGAAG TCTTGGGGTT GCTGTAATTT AAACATGACT GAATAGATTA TCAAAAGTTA 60
TTTATCGAAT GGGTGACATA CTCTGTTGAC CAAGCTGCGC ATGCGCAAAC AAAAACATCA 120
GCGAGGTAAC AGCGACACCT GGTGGACTTA GAATCACATC GCTCTTTGAC TTAGTAGACG 180
AACTACTAAT TAATTTAAAC ACACATTAAC AAACACTTCA ATATTTTAGC ACTTCTATAC 240
ATTTTATGAC ATCAAACCGC TAGCTTTGTG ATAGTCCGAG CTAAATTCTC ATTATAGTTT 300
TGTCACACGG GATGTAAACA AATAGCTAAC GTAATTAGCT TAAAGAGGAT TGTTTGCTTA 360
TTATATAAAA AATGTTAACT CTGAAATATT TGAGAATGAA GCTGACTATT TTAGAATGAT 420
ATAAACCATA TTTTACCACA GAATTCACAA TTATTGAATG ACTTACCGCG ACGTGTGTTA 480
TTCGGGTTAT TCCCCCTTTT ATAAAGCCAC TTCCGGTTGA ATTTAAGATG AAAGTGTGTT 540
TTTTGTGTGG TTTATTAATA AGCTGCCAGT ATTTACGTGC ATAGACAAAT AGTTATATGT 600
TATCAAAATA AAGCATTGCA AGACAAATAT TAATAGTATT GTTAAGAATT TCTTTAAATA 660
AATTTAACGA CCCACAGCAA AATTTCTCTG GTCCACACAA TCAGCTTGGC CTGGCCCACA 720
TACCTCAGGG AATTACGGTA CATGACTGGA TCAAGTTTGC CTTGCAGACA AAGGGTCAAA 780
CATTGAGTCT CAGTCATGTT ATGACTGGCC TGAACTGGGC CAGATATGGC ACATGTTTGG 840
ACTGAAAGCT GGACTTGGTG TGTCATGACT GCAGTGAAAT TGATATAAAA CCCATTTTGC 900
ACTTTAGGCA GGTCAAAACC TGCAAAAAAT ATACATAAAT ATGCAAATAA ATAAATAAAT 960
CCACAAATTC ATGCCTAAAT AAAGCAATAA ATAAATATGC AAATTAATAA ATTAATAAAT 1020
CCACAAATTC CTGCATATAT AAAACAATAA ATAAATAAAT ACGCAAATAA TTAAATAAAT 1080
CCACAAATTC CTGCATAAAT AATACAATAA ATAAATATGC AAATAAATAA ATAAATCCAC 1140
AAATTCCTGC ATAAATAAAA CAAT 1164