EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-06405 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr13:44678598-44679693 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr13:44678777-44678796TTTCCAGCAGATGGTGCTG+6.02
Foxj3MA0851.1chr13:44679569-44679586TGGTTTGTTTACACTTT-6.22
NKX2-3MA0672.1chr13:44678845-44678855ACCACTTGAA+6.02
POU4F2MA0683.1chr13:44679294-44679310TTTCATATTTAATGAC+6.01
RUNX1MA0002.2chr13:44679564-44679575GTTTGTGGTTT+6.02
Enhancer Sequence
AGGAGATGGT GCTCTAGGTT AGTTTTAATA GCAGACGTCG CTCTAGGCTA GTTTTCTTGA 60
CAGCAGATGG TTCTCTAGGC TAGTTTTTAA CAGGAGATGG CCCGTTAGGC TAGTTTTTGA 120
CAGCAGATGT TGCTCTGGGC TAAATTTCTA TACAGCATAT GGCACTCTAG GATAGCTTTT 180
TTCCAGCAGA TGGTGCTGTA TGCTTTACAA ACAGCCATAC TCTTCTTGCA TCCAATTCCT 240
AACAAACACC ACTTGAACCA AAAGTGATCA TCACCAAATT TCAGAAAGGG AATGACAAGA 300
GTGTTCACAG TGAGCTGTGT TTACATTAAA CTTGTGACAG TAAAAGCCAT CTTATCTGAC 360
TCGCCAAACT AACAAGTGCT CCTCCTGATC AGCATTTGAG TTTACATTTA GGACATTTAC 420
ATTTTTTAAA GTTCCATCTG CTATTTAAAA CCAACCTAGA GCGCATCTGC TGTTAAAAAA 480
ACTAGCTTAG AGTGCCATTT GCTCTTTAAA AACATGTGCT GTGTCCCAAT TACGCCCTAA 540
AAAATTGTGT ACTTTTTTGT AAAGGTAAAG TATATACTTT TGAGTGTGTA ACAGAAGAGT 600
ATGCAAACTT TGGGACATGC TACTTCCCTG TTAACAGATC ATTACGTTGC TTAGTTATGT 660
CCCTTGTCAA TCATCTTGAC ACATCATCCA CACTTCTTTC ATATTTAATG ACCTACCTTA 720
TTGGAGAAGC AGCGGCAGGA TAATCTGCCA TTCACAAGTC TTTCATGCAG AAAATCTCCC 780
CAGTTCTTTG GGTAACTATG CATTCAGAAG TTAGTGTCCA AACACATCTT TATATAAGTT 840
CAACATGAAA TACAACACAG GAAACAAGGT TTAAATATGT TCCAGTTGGA TAGATATTGA 900
TTAACAGTCA TTCAAAGAAC TTTACCGAAG CCTCTCTACT TGACGATTGG TCTCGTGTGT 960
CACCAAGTTT GTGGTTTGTT TACACTTTTT ACCCTAGTTT GTAGTTCTAA TCAAATTCAC 1020
ATCCAATGTG CAATGTGTTG TGGGCAATAT TAGCAGTTAA AGTATGGACG CTTCTACATT 1080
TCCAATTTTT ACATC 1095