EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-06400 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr13:44492110-44493517 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NHLH1MA0048.2chr13:44492991-44493001CGCAGCTGCG+6.02
NHLH1MA0048.2chr13:44492991-44493001CGCAGCTGCG-6.02
STAT3MA0144.2chr13:44492457-44492468CTTCCCAGAAA-6.02
Spz1MA0111.1chr13:44493268-44493279GCTGTAACCCT-6.14
ZNF263MA0528.1chr13:44493102-44493123TATTCCCCTCTCTCCTCCTCT-6.45
ZNF384MA1125.1chr13:44492496-44492508AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr13:44492495-44492507TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr13:44492494-44492506TTAAAAAAAAAA+6.44
ZNF384MA1125.1chr13:44492493-44492505TTTAAAAAAAAA+7.22
Enhancer Sequence
GCTTAATAGA ACGTCAATAT AAGCTGTTTT ATATATACAA AATAAAAGTT ATCTCGTACA 60
ATGAATGTAT AAAGAGCGAG AATATGCAGC TTCTATTTAA TTTGAACGGA TGCAACTTAA 120
GGAGTCAGAT TTTTATATTA ATATTATTAT TCGAGTAAAT GATGTGAATA AAAAAATCCA 180
TTTGAAGATA CCCGCCACAA AACCTACAGA TATAGCATAA ATTTGGGTGT GGACACCGAG 240
CGCTCACGAG CATTCACATT CACAAAACCC CTATAATGAA ACAGATGCAC AGATATAAAG 300
TAGCGCTTCT ACCTTCCTCT GCGCGAGCTC AGCCTGTAGA TCGCTGCCTT CCCAGAAAAA 360
AAAAAAGAAA TAATCCCCTT TTTTTTAAAA AAAAAAAAGC AAGGACTTTC AGCAGATAGG 420
CAGGAGTTCC AGGTGTTTAG TTAGTTGCGT GTTCGGCACC GATGTCTCTC CGTGCAGAAA 480
ATCAAGACAA AATTCCAACA CATTTCATCC AAGCAACTTC AGCTGAGCTC AAACTCTGCA 540
CGCATCCAAG AGAAGAGGCG TCTTGATGGG AAGCAGGAGT CCGATGCTGT GTGTGTGAAA 600
GAGTGAGTGT GTGAAACTCT TGTCCTGTGA TGTTCTCCTA TCAGATGTGT GTGTGTGCTC 660
ATCGATGGCT CTCTCCAGAG TGAGGCGGAT GGAGAGCTCG CGCGCACAGA TCTCTCCGGC 720
TGATGCGCGC CTGATATCTC AACAGTGTCT GCGTAAAAGC GCGTCCAGCG CTGGTCTCCG 780
TAATGAGTGG CTTTATCAGA AGGGACCGGT GTCTAAACTG TATAAACTCT GGGCTTTTTT 840
TCCAATAGTA TTTTGGTGGA ATCTCCAGCC AATTAAAGCC GCGCAGCTGC GAGCGGAGGA 900
CTCGCCCCGG ATCCCGAAGG ACCAATTAAA TAAGAAAGAG GGAGGTAAAA AAAAATAAAA 960
AAAATCACAA TGTCTCTCTC ACCCCTCCTC TTTATTCCCC TCTCTCCTCC TCTGGCTTTC 1020
TACTCCATCT CTTCTTCCAT CAGTTTCTCT GTGTCTGTCG TCACTGATGG TGCGGACACT 1080
TTTTGAAGTG AAGCGCGCCG CCTATGGTGA CCGATAGGAG GCGTGTTTGA GCTAATTATA 1140
ATTCCGGAGC GCGCGCTCGC TGTAACCCTT GCCCATGTTC ATCATGAAAA AACTAAGCGT 1200
GCGTTAGGTC AGAAATCGAT TAAAATATCG ATATAAAGTT TTTTCAAGGC ATCATGCATG 1260
TGGTCTGATT TTGTCTTGGT GAATCTGTCT AAACAATAAG AAACAAAACT TAGTTATATA 1320
TTAAAATGCT TAGATTTAGG AAATATTTAT TAATCAGTTT AACATTAGTT TTTTTATTTT 1380
TAAATTGTTT TTATTTATTA ATTTGCA 1407