EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-06316 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr13:40026680-40027930 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr13:40027071-40027081TTTAATTAGA-6.02
ARGFXMA1463.1chr13:40027071-40027081TTTAATTAGA-6.02
HNF4GMA0484.1chr13:40027887-40027902TGAACTCTGCACTCT-6.01
LMX1BMA0703.2chr13:40027604-40027615TTAATTAAAAT-6.62
RUNX1MA0002.2chr13:40026892-40026903GTTTGTGGTTT+6.02
Enhancer Sequence
TGTCTTTTAC TTAAAATAAT AATAATAAAA AAGTTTTAAT ATGTAGTTGT CTGAAATTTA 60
AATCCAACAC ACTTAAAAAT TAACATTTAC TATGATTAGT TACATACATA TTATTAACGA 120
AATAGGATCT CATCAAAGCA TGCATGCATA AAAAGCAAAG CATAAAACAT AATCTTTATA 180
CAGATCAAAA GCAGAACAAA TAACAAACAT TTGTTTGTGG TTTCTTAATT GTTTATAAAG 240
TCTTTTAAAT CCGAAAAGCA GATGCGAACT AAACAAATGC GAACTAAATA AACAGAACCA 300
AGACAAAAGA AAAACAACCT GGAACCTTTA TCTGATCTCC CGAATATTTA TCAATATCAC 360
TTATCACATC TCATCCGATC GGCAAAGAAC GTTTAATTAG ACGCGCGCCG AAAGATCAGA 420
TCAAAGCAGC CGCTTTAACT TCAAAGACAC AATGCGGCAG ATATAAAAGC ACCGCTACTT 480
ACATGAAAGA AAGTCCAGCG CCGCTCATCA GTGATTGCCC TCCTCATAGA TTAAGAGATT 540
CCCTGTGGAC CTTGAGTATG TCTCGTAGTG ATTTTACACA ACTTCCCAAG AATTTGCTTT 600
ATGAAATCAG CTGTGTAAGA ATCTATCCAA TCACAAGCCC CTGCAGTGCA TATTTAAAAG 660
AGGCAGCCAA TGACTGAGCT AAAGGGCGGA GATAGGATTG CAGAATCACG CTTACCTGAG 720
ACTCCCTACT CTATAATTCA TAAGCACGGC TCAGAAGAAA GATTTAGTGA CATGATTTTG 780
AATCTATTCA ATCAAAATAC ACACGAATGA AGACATTTAA AAATGCAGTT AAATATGCAT 840
ATGCAAGTAT AAATAAAAAT GCAGTTCGAA AAATAAGTTA TCTAACATTA TGTGTGTTCT 900
ACCATGTACT TTAAATGCAC TTTCTTAATT AAAATACTGA TTGCCGGTCT GATGATCGTT 960
TAACCATTTT ATGGGAACAT TTCATGGATC CGTGGCATTT ATAGTAAAGT GAGGGTTCAT 1020
CTACTGGGAT GTTGGCAGAA GTTCATATCT CTATAGTTAT TTCGTCCACT CAACAAACGT 1080
TCATATCAGC ATGACCTCTT AAAGAAACAG AAAATCTTAC ACTTAAACTG TAAATCTGTT 1140
AAATACAGCT ATAAATGCAT CATTAACGTG TATTATGATC TTTTGAAATA GAATAATGTG 1200
TTCATGGTGA ACTCTGCACT CTATAAATCC CAAATCTCAT TATTTTAAAA 1250