EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-06305 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr13:39374184-39375428 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr13:39375086-39375098AAACCAACATTC+6.04
RFX5MA0510.2chr13:39374600-39374616GGTTGCCACAGTAACA+6.08
RFX5MA0510.2chr13:39374600-39374616GGTTGCCACAGTAACA-6
Enhancer Sequence
AATTCAATGT TTTCCAAGTC ATACTATTTA AACGTCTCGC TTTACTTCTC TGCGTATGAA 60
TCTTTATTCC AAACATGCCT TCTAATGTGT AGACATTGTG AAAAATGCTT CAAAACAGTG 120
AACGTGAAAC TGCCAAATCA AAACAAGCCT CTGTGGATTT ATGTAGGCGT TTAGCTCGCT 180
GAGTAAAAGA TTAAATTAAA CATGTGTGCA TACATTCAAA ACCAGTAGCC ACCCACGCAA 240
AAAAAACATG TGCATATATA CTTGTGCCTC TAGGTTTGTG GAAGAGCTGA GAGAAAGTGA 300
CAGCAGAGAA AAAGAGGAGA ACAGATGAAG ACCTCCTGAG CTGAAAAGTC ATGTGATGCC 360
ACACTGTACT TTGAGTCTTC CAGGGAGACA AAAACACTCG CTCTTGCTAC TATCTGGGTT 420
GCCACAGTAA CACCAGCACG CTGTGATGCT CAGCCCTCAA AAAGATTCAA TGCGAGGATG 480
ATGTGTGCAG TCAGTAGATC ATACAGTAAC AATAAACCCA AATTATCATT TAATGAACAT 540
GGCTTGACGT CAGCTAGTGC CGAGAAAATA AAATCAATAG AAAAAATGCA CATATTGGCA 600
AAAACATTAT AGCACACAAT ACATTAGACA AAATGGAATA GCCGGCAACT TTAACACCAC 660
TCATAAATAA GAAAGTGAAC TACTTACTTG TTTATAAATA GGTTTAATTT TGCAGTTATG 720
TTATGATGCA CTACTACAAA TATGGGAAGT GAATGACTGA ATGACTTTCA ATAATGAAAA 780
TTGATTAGTA TAGGTTTTAC GATTAACGTG CATTCGTAAG TTATGCTAGA AACTGTTTAG 840
GGATAGCATA CTACACAATT TGCCTCATTA ACACAAATTT TCTTACACTA AAACCATTTT 900
TAAAACCAAC ATTCTTCAAA ATTATGCAGT GCTTGACGTG TTAAAGCGTT TAATCGTTAG 960
GCGTACTCAC CAATTCTCTT GTCCACTGCC TTTATTTAAT CCAGACGATT GGGAAACTTC 1020
TTGAGGAGGA CGCCATTGAA CATATTTCAA CTTCAACCTC TCATTCCAGT CAGGTGGACG 1080
CCAAACATGA TGAGAAAATT ATCCAAGTAG CAACCAAGGA AGAATACGGT ATTGCTTCAA 1140
CAACAAAAAA AAAATCTGTT CAAGTAAATC CGTAAATTCA GAAGTGATTA GAAAACGATT 1200
CGCCTCAACA TAGGCCTCCT GACCTTCTCC CTTAATTTAA AGGG 1244