EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-06291 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr13:39055751-39056929 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXD10MA1506.1chr13:39056544-39056555GTTTTACGACT-6.02
HOXD12MA0873.1chr13:39056544-39056555GTTTTACGACT-6.32
PHOX2AMA0713.1chr13:39055790-39055801TAATTTAATTA+6.62
PROP1MA0715.1chr13:39055790-39055801TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr13:39055790-39055801TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr13:39055790-39055801TAATTTAATTA+6.62
RUNX1MA0002.2chr13:39056916-39056927GTCTGTGGTTT+6.62
Enhancer Sequence
ATAGATGTTA TATAAATGTT ATAATTACAT TTTATTGTTT AATTTAATTA TTGTTTTGGC 60
CATTTTATTA GGTACACCAG TTTACGGTGT ATTGAAGCAA CCGGAGATTG CTTGCTAGTA 120
ATGACTATAG CTTAACTAGT CTTAACTAGT CTGGTCAGCT GAAAACCAAC CATAAAATCC 180
ACCTGGTCAG CCTAGTAGAA CAGAAGGAAA CCAATAAACA TTTTTTGCTA AATATGAGAT 240
TAAAATCCTG TGTTGCTGCG TTTGCAAACA TTCTGTCATA ATTTTAATTT TCAGGTATAA 300
TATTAATTTT TTAAAACCAA AATAGAGGTA AATCGTTATA ATAAATAATA ATAAATAATT 360
GAGTGAATAA TATCTTCAAT AAATAATAAG GGCAGCAGGA TTTATATATT AACGCCTTTG 420
ATAGTGACCG GTGTTGTACC GGCTTGTGTG AGTGTGAGCG CCTCCCTTAA ACTCAGTCTT 480
ACAACACAGA GAAGACAAGT TTGGACAATA TTTACGATCT ACGACTCTCA CCGCTCACAT 540
TATGGAGATG TGATTTATTT TTTCATCAAG TCCGACCGAC CTGGAGTTTT ACCTCTGCTT 600
GAAAGACAGG GCTTGGGCGG ATTTTCAACG GCATGCGGAG GAATTAGGCA GCCGGGTGAT 660
CAGAGCGTCG TGGCGGCATT GCTCTGAAAT CCAGCCCGTG GTTTGAGGCC TATATTCCCG 720
AAGCGGATAC ATGTACGTTG TTTTTATGTA CCCAAAAGCT ATATATTTCA TCAACCGATA 780
TCTGTTTTGT AGCGTTTTAC GACTTGTGAT AGGTAACGTT AGCATATCTG TTAAGCTACG 840
CAAATAGTGT TATGTTTGTG ACGGCGGGTC ATTTGACAAG CAAAACAGGC TAACGTTAAC 900
GCTGGAGCAA ACAGGACGCG ATTCAAACAC AATATACATG AATTAGAAAC GATAAGCTAA 960
TAATAAGAAA CTAAATCTTT TCAACATATA CTAGTCTATG CTGTTAAGTA ACGTTGATCG 1020
TGCAGTAATG TAATCTTCAG AAAATAAGGC TGCGATGATG TTTGTAGTTG AATTATCAAA 1080
CGTTAATCAG GTGCTTATGT GCATGTTTGT TTTAGAGAAC TTTTATTTTA CATGATAGTG 1140
AAAGTTGGGT TCATATCTTT TTACAGTCTG TGGTTTAT 1178