EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-06060 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr13:28328665-28329967 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid5aMA0602.1chr13:28329002-28329016GTAATATTGCAAAA+6.49
Foxd3MA0041.1chr13:28328687-28328699GATTATTTGTTT+6.07
HNF1AMA0046.2chr13:28329824-28329839AATAAATGATTAACT+6.95
HNF1BMA0153.2chr13:28329825-28329838ATAAATGATTAAC-6.27
Enhancer Sequence
CAATAAAGCT CTTCCTGATC CTGATTATTT GTTTTTATGC ATTATACTGT TTTAAGTAAG 60
AATGCCTGTA CAGCACTTTG GTAAACTACA CACTTGATGT TTTTTAAAAG TGCTTTATAA 120
ATACACATTG ACTTGATTTG GCTGTATTGA AAATAATAAT TAGAAAAAAG TGACGAAGAG 180
CTTAAAGTTA TCAATTTTTT CAGTAATTAT TCTTTTTGGT TTCATGTTTA TAGCACTTTA 240
CTACTACATT CTGTAAATTT AACCAGAGTT GTTGAATCTG CTGTGAATCT GTTGCCTTTT 300
TTGTTATTAG TTAGTTTTTT AACACTTACA TTTCTTGGTA ATATTGCAAA ACCCTCATGA 360
AGCTTTAGCT TTCTCCGAGG GGTCATGAAA AAAACAGTGC TGGCCAACCT ACATTCATTC 420
ACAAATGCCG GAAGACATTT TACTGTCCTA ATTTACAACG TCAAAACAAT AAGCCAATAC 480
ACAGCTAGAA TACGCAAGGT ACGTGTGTCT GAGTACAGTC TTCTCTTTTA TATGGCTCTA 540
AAGGGAGTTT ACCTAGAAAC CTATTTGAAG TCATTGTACT TCCATTCTTT TTGTGTAGTG 600
GGCCTAAATT TCAACAAGTA GTGATAGGTC GCAACTACCT GTAACGGCGG AGTATAGCCC 660
TAGAAAAAAG AGCCTTGAAT GTCTGCCCGC TACGAATGAC AATAAGCACA ATTTCCCAGT 720
TTGCATTGTG GCCTGTAGTC AGTGAGTGTG AGCTGGACTC TTTATCAATC AGACAGGGAA 780
TTTCTTTCAC CCCTTAGGTG GCACTTTACA GCTCTTTAAA GTGAAAACAA TGAGAAGCTG 840
TAACCAGCCA GGAGTTATTA AGTGTTCTTG AAGGCTAGTG CTTTAACCTT TAACGGTCTG 900
GGTCATCTGC TCAGCATCAG TACAAAAGCG CCTTCGTATT ACCTTACAGA CTATCTAGCA 960
CACCTGAAAA GCCATGCTGG TGGACAGTTT AGCCCAAAAC ATGAATTGAT ACAAATGTTA 1020
TTCCAAACCC GTAAGACTTT CTTTCTCATT TTTACTGTTT ATGCATACAT TAAATGTCTA 1080
TGGGGTTCAA AACATTTTAT TGTGTGTGTG TTCCACAAAG GATATTAAAT TAATGCAAAT 1140
CTTGAACAAC AGGAGGGTGA ATAAATGATT AACTATCGCT TTAAGGTGTC ATTAACCAAA 1200
GTTGTGAATT TAACCTAATA AATGTATATT GCATATTTGC TAATAAAGCA CCTGTGGGTT 1260
TAAGAGAACA AAATCACCTT TCCAGAGATT GTAATAAATG GC 1302