EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-06053 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr13:28031812-28032568 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr13:28032533-28032552CGGCCACTAGGGGGCGATA+8.05
Rarb(var.2)MA0858.1chr13:28032218-28032235ACGTCAACTTGAGGTCA+6.69
ZNF384MA1125.1chr13:28032075-28032087TATCAAAAAAAA+6.14
Enhancer Sequence
ATGGCGCCAA AAACCAATAT TTTGGACATT TTTGACCGCT GTTCGTTCAC CGTTTGTCGT 60
AGACTCAAAA ACTTTACATT TTTTCAATCC TTGGGTTAGC CCGAACAAAA GTGTATAGCA 120
GAACTTTTTG CTCTACGACG CACCGTTTTC CCGCTACATC GCCATTTGTC CGAAACCTAC 180
TTTTACGAAC TAGTCCTAGG TTTTTCACTC AATCTCAACC AAACCAGCTC TCAAATGTTC 240
TCTGGACACT GAATATCAAT AATTATCAAA AAAAAGTTGA AATTTTTATT CTCGCGCGAA 300
ACAGTACACA AAAATGTTCC ATGCTAATTG AAGCTAAATG CTAATTGCAG CTATAACTTT 360
TGAATGGAAT AAGATATCAT CACCAAACTT GTAACACATA TGTATAACGT CAACTTGAGG 420
TCACAGTGCA AAACTCGCAT ACTTTAACCA CATGGTGGCG CTATAAAGCT AAAAAAACAT 480
AAAAATTGCT CTAACCTTAC AGCCATTAGT CCAATCAGCT TGAAATTTGG CATGCAGTGT 540
CTTTGACCAA GTTGTCATAA CATACTATAA GGACATTGGC ATACCTCAAA AAACATGGCC 600
GCCATTGGCC AATTAAAATT GAGCAGCCAT TTAACAGGGT TAACGATGAG TGATCGGAAC 660
GAAACTCGCT GGGCATGTTC AACTCATGGT CCTAGAGGTC TGTAAGAATT TTGAAAGAAA 720
TCGGCCACTA GGGGGCGATA TTACATATTT TTACTG 756