EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-05998 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr13:26685264-26686140 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr13:26685491-26685501TTTAATTAGA-6.02
ARGFXMA1463.1chr13:26685491-26685501TTTAATTAGA-6.02
Arid3bMA0601.1chr13:26685752-26685763ATATTAATTAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr13:26686025-26686035GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr13:26686025-26686035GTCACGTGAC-6.02
MITFMA0620.2chr13:26686021-26686039GTAGGTCACGTGACGCTT+6.14
MITFMA0620.2chr13:26686021-26686039GTAGGTCACGTGACGCTT-6.14
RORA(var.2)MA0072.1chr13:26686016-26686030ATTAAGTAGGTCAC+6.05
RORCMA1151.1chr13:26686017-26686029TTAAGTAGGTCA+6.52
USF1MA0093.2chr13:26686024-26686035GGTCACGTGAC-6.14
USF2MA0526.2chr13:26686021-26686037GTAGGTCACGTGACGC+6.38
Enhancer Sequence
AATTAGCATT TTAATATGTC GGGTTAAACC TCTGTGTATT CACTTTCTGT TTGTTCATTA 60
ACAGATGTGC ATATAGCTAG TGTTACTATA TTTAGATCTA TTACAACTCA TTTGATTTTT 120
TTTTACTTTA AACAAAGTTA TGTTTCATTT TTAGGAACAT TTTATAGATT TTTCTCTCTC 180
TATCGCTGTC ATTCAATCGC AAGCAAACAC AGGAGATAAA GTAAGGCTTT AATTAGAGAT 240
GTGTCATTAA AATATCCTCT CTTTCCAGAG ATGGTGGGGG TTTGCTTCTG GATGGTTGGG 300
TGGGTATTAA CAAGTTCATG GATCTTATTA CTTTCTCCCT CCGTTGCATG CTGTCAGCTC 360
CTAGGGATAT GATATCCGAT GGCTGGGCTC ACATTTACAA CAAGTTCATT ACGGCACGAC 420
TGCCGCTCTT TCTGCTTGGG CCCAGCTGGT TGGAGGGGTC TGTGTTTTAA TTAGTGCTGA 480
GGGTGTGCAT ATTAATTACA ACATGAGTGA TATTTACTGT ACCTAAGGAA CACAGGACCG 540
GCTAAAGACA CTGGCAGCCT CAGCTAATAA AGCCAGCCAT GCTAATGAGC AAAAGGAACC 600
ATAAAAATAG ACGGCGGCAA AATAATTCAT AAAGTTTATT GATCTCGGAG TAAAGACGTT 660
AAGCTCCGAT TAAGGGCAAC AAAAGGAAAG GCATCGCACT TTATCAAATA AATAAGCCGA 720
GTGGAGAAAT GTGAGCACGG AGACAGATTG TCATTAAGTA GGTCACGTGA CGCTTTTCTC 780
CAGAGAACGG CAAATATTCG TTCATGCGGT GAAAGAATAA AATAAAGGAG GGGGAAACAC 840
TAGAGTTTTC TCATAAATCG GATGAACGTA AAACTG 876