EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-05774 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr13:17991035-17992091 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr13:17991591-17991604TAATTAATTATTT+6.71
POU4F1MA0790.1chr13:17991592-17991606AATTAATTATTTAG-6.07
POU4F2MA0683.1chr13:17991590-17991606GTAATTAATTATTTAG-6.19
POU4F3MA0791.1chr13:17991590-17991606GTAATTAATTATTTAG-6.09
Enhancer Sequence
GCATATTTGA TTATTTTATT GGTTGTTATT GTACTGTTTT GTGCATTTAT ATGTGATTCC 60
TCCACCTGCT GTCATGCAAG GCTAGCTGCT GTGCTAACAG TCTGAATCTC TGCTCTTTTC 120
ATTTGAAGTA CTGCTTTACC TTATGAACGT ACTGTTGTCA GATATCCTCT GTAGTGTTTT 180
CCGTCACCTC AAAATCTCCT GAATCCAGCA GAGAGGAAAG TCAAGGGTAG TTTGTCGCTG 240
TTTATTCGCC CCATCATCAG CTCAGTATTT TGAGAGGTCG GCCATGTTCC GTCTGCAGAG 300
AATCAGCTGA TTCTAGTCAC CTGACCGAAG CGCGAGACCC GGAGCCACTG ATCTGAGATC 360
AGCTTCTGAT GCGCGTGACC GACACTTTAC TGAAACAGAG CTTATTTTTT CATCTGAACT 420
CAAATCTGCA CTTCCTGACA GCAACGTAAC ATGGTTTATC CATGCTTTTT GTAGTGGATT 480
TTCATTATTG GGTGATGTAA ACTGTTAAAA AGATGCAGTG CTCATGTATT TTATCACATA 540
AAATATTCTA AAATTGTAAT TAATTATTTA GTTTGTATGC ACACAATGCT GAAAATCGCT 600
TTATGTAATG ATTAGTTGGC TGACAGGTTT TATTTCAAAC CACATGCATT CAAACATGTG 660
GATGAATGTT TGAGTGTCTG GCACCCTCAT GAGAACTGCA GTTGAGCGGA TGTTGTATTT 720
TTATTTATTT ATTTTTAAGA ACAGCAAAGA TACAATTTAA ACATGATATC CAAATAATAC 780
AAATGTAACT AATAAACTAA ATAAACTAAA ATATAAATTA CATAATCAAA ATAAATAAAA 840
GACAATTTCA ACAGAACAGC CTTTACAATG ACAATATAAC CAGATGATTT AACCTACCCA 900
ACAGACAGCA AGTTTACTAT TCAATTTACT TCAGCTCCTT TCCTTTGCAA TTATCTTGAC 960
ATGTCTTGCT ATTAATATAA TGGAGTGAGG CTATATATAA ATGAAAATCT ATAATAGAAA 1020
CCTTTAAACA AGGTTTAGAG GTATTCAATC TACATT 1056