EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-05769 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr13:17562021-17563265 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr13:17562923-17562934ATTTTAATTAA+6.62
POU4F2MA0683.1chr13:17563198-17563214CTAATTTATTATGCAC-7.57
POU4F3MA0791.1chr13:17563198-17563214CTAATTTATTATGCAC-6.41
RUNX1MA0002.2chr13:17562120-17562131AAACCACAGAA-6.32
SOX10MA0442.2chr13:17562506-17562517TGCTTTGTTTT-6.02
Enhancer Sequence
GTTACTTGTC TTTTCTGCAT CTCTGTGATC AGCTCCCTTC AGAAATTTAG GAATCTTGTG 60
TTATGTTTTC TGTAGCAGGG GGTTATTCTC TCACTCCTGA AACCACAGAA CACTTTTTTA 120
CTTAACATTT GTTTAAGATA ACGTTACTAT GAAATATCAA AACACGATTG AACTTTTGAT 180
TCACGGTCCT TTACAGTACA ATGCGTATTA GACTAACGTT ACATATGGAG TGCATTAAAT 240
AAAACATTGA CAAAACCTCT CATCTACACA TAAAGAATAA ATAAAAGCCT AAACTTTAAC 300
AAACAAGTTT AACAAGAGCT AACATTAAGT AAGTTAACGT AATATTACCC CGACGCTAAC 360
GTTACCAGTG CTAATATGCT AACAGACTTT TACGAAGACT TACCACTCTT ATATAACATA 420
ATATTCAACT GAATATTCAT CAATTGCCAA TAATAAAAGT GTGAGGAACA GTTTTATGTA 480
GTATTTGCTT TGTTTTAGGG ACTAAACTTA CCTGAAAACT GTCAAAACGG CAGCTTGAGA 540
GAAGTCGTGT TGTGTCTTTC AGGTGGTGTC GTGTCGTGTT GTAGCTTCGT TTCCCATAGC 600
AACATCCCCT CCTCTCCAGT GTTGGAATGA GACGCGCGCG CGCACATCAA AGTCATGCAG 660
TATTACATTT ATAAACATGA TCACTCCATA GACTATTTAA ATAATAACCT TGTATTTTAT 720
ATATTGAATT TAAAATGTAT TTAGTAGTTT TATATACGCT ATTATCTTTA AGACGAGCTT 780
TATAGCCTAC TAATCTGTTA CAAAACAAAC ACTTATTTGT GCATCAGATT CACTGTCAAA 840
AATAAATAAA TATAAATGCA AGTATATATA AAACAAAGAT GTCACTCTGT AAAAAGGTGT 900
TTATTTTAAT TAAACAGCCG AACATGCAGA ACATACTTGA TTTTTACACT GAGAAAAATG 960
TAGGCTATTA GAAAAAGCCA CAATAAAAAA AAGCAAACAG CAGTTAACAC CAGAAAAAAA 1020
CAACGTTTTC ATTATTTAAG CATAACAACA AAACTTTTTA TATTTTAATG AATTGAAATC 1080
ATGTGTTGTA GGCATTTTGG TCAGTTTTAC TGCATTAATG TAGACTATTT AAAGCTGGAC 1140
CGACCGACGC AGTTCACATG ATGCATGTCG CGTTTGTCTA ATTTATTATG CACGCAAAAA 1200
CTTACTTGTA AACCAAATAT GTTGCCGGAT TCCTTCATGG GCAT 1244