EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-05729 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr13:15726252-15727402 
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxq1MA0040.1chr13:15726711-15726722TATAAACAATA-6.32
NKX2-3MA0672.1chr13:15726501-15726511ACCACTTGAA+6.02
Enhancer Sequence
CATCATGTCT GCAGTCAGCT GCTTTGGCTG GTGACAAAAC AAGGACCTAA ACGATTCCGG 60
GTGTTGTTGG ACTTTAGCAA GGACACCAAG TGTTTTCAGG CCATCTCTGA ACCTATAATA 120
GGGACCTATA TTAGCTTGGC TTAATATAAA GCATAAAAAA TAGGTGCGTT GTCACAGTCT 180
TTACAAGAGA ATTAAGTCGT TATTAAATTA TTTATAACAA ACCTTTCAAA TGGTCCACGG 240
ACACGATTCA CCACTTGAAA CATAAGCAGA TCTTCAACTA GCCTGTCCTT GTCATCAATG 300
TTCTTTATAG GTCTAAGACA ACCAGCATTG GCTAGGAAGT CCATGATGGG CTCAGTTGAC 360
TCTCGTAGCT CTTCCACAGT TGAGGCTTCA GAAAGCTGTA TGCAAACAAA TAGCACGTGC 420
ATTTCAAATT TATTTACAAG TATACCAGAG AAACTTTTCT ATAAACAATA TTTTAAAACT 480
AAGCTATGTC TTTAATATAG ATGGAACATA CTGAAGTAAA TGAGAGAATC CATGATGAAC 540
ACTTTAAACA GTTGTAACCT AACCTTTTTT ATTTTACTAT AAATCTCAGG GTCAGCTACA 600
TCCTCCAAGC CAGGTCTGCA CATGTCTGGT CCCTGAACTA AACTGTCATA TAGCGTTTTT 660
GAAAAACAAC CAGGTGCAGG TCCTCCATGC ACAAGACTGA CTGCAACTGC TCTCCCTGCA 720
ATGAAATATC TGTCCTCCCT CATGGCTGAC ATAAAATTAA AGAAGAAGTG TCAATACAAC 780
AGCGTTAAAA GATTTAAAAT ATAAGTTATG GAACATGGAA TACAACTTAT TAAATCTTTA 840
CAAAAAATAT AATGTATACC TTGTGAATCA AGTGCCAAGT TTATACTGCC CTCTTTTCCA 900
TCAAACATTG ATGACTCCAT TAGTGCCACC AGGAGGAGTC GTAGAAATTC TCGTCTAGGG 960
CCGCCCAAGT CAACAGCCTC TTCAAACTTT CCTTTATCGT CGGAGAACCT AATGACCATT 1020
CTGTTATTTG GACTGTAGGA CATTCGCGTA AATCCCCGTA TAGCACCATC CAACACAGAT 1080
GCACGATTAA TATTAAACTT GCAGGTTTGG TTGCCATTTA TTTTTGATGC AAGTTCCTCC 1140
AGTATTTCCT 1150