EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-05649 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr13:15035138-15036370 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr13:15035154-15035171GTTAATTAATTAATTAG-6.16
Alx4MA0853.1chr13:15035154-15035171GTTAATTAATTAATTAG-6.1
Creb5MA0840.1chr13:15035559-15035571AATGACGTCATG-6.02
JUNB(var.2)MA1140.2chr13:15035559-15035571AATGACGTCATG+6.04
Lhx3MA0135.1chr13:15035160-15035173TAATTAATTAGCT+6.09
Lhx3MA0135.1chr13:15035156-15035169TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr13:15035157-15035170AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr13:15035153-15035166GGTTAATTAATTA-6.98
POU6F1MA0628.1chr13:15035158-15035168ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr13:15035158-15035168ATTAATTAAT-6.02
Sox3MA0514.1chr13:15036330-15036340AAAACAAAGG-6.02
ZNF24MA1124.1chr13:15035141-15035154GAATGAATTAATG-6.2
Enhancer Sequence
TATGAATGAA TTAATGGTTA ATTAATTAAT TAGCTAGATA TTTCCGAACG CCTGGTGTAG 60
TAAAACTAAG AATAAAATAG GTAAATTGCA GCATATACTG TAAACCTTTA TTACCGCATA 120
TACAGTGGCA ACTGTTCAGA GTAAAGCCTC TGTTTTTGTA TAGAGGACGT GTAAAGCAGC 180
AATCAGAGGA TATTCAGAGA GTTTCAGGAA ACGCTCAAGG GCAAAAAGCA ACAGGAGTGG 240
ATTAACACAA CTGAGCACGG GAAATGACAT TTAACTTGTT AATATGTCTA GCTTTAGATT 300
AATGATAAAT TGTCTATTAT TTTTTTCCGT AAAAGAGAAA GATAAGGCGG CTGTTTGGCC 360
GAGGGCCCGA GCGCCGTTTG TATGCAAAGT GACAGCCAAT TAATGAGCGC TGAGCTCGCC 420
TAATGACGTC ATGCCTTTCA GCGTCTAGTT TCGGGTAATG ACTTTTCAAT GAATCAACTG 480
ATTGAAATGT AACTTGCCTG GCCTCGGGCG AGCACCTAGG AATAGCTTGA ACGGAGGCAA 540
TCAGAAGATG GCTGAAGACA AAAAGCCTCC CCTCCTTACA AATCAGTTTC TTCGTATGGA 600
GCTGCGGCCG ATGTTGCTGA TCTATTGGCT ATGCTGGAGA TATGCATACA TTGATGAAAA 660
TATTATTACG CCACAGACTG CTTCGAGCAT ACATGCATTA GCATATTCAT AGTAAATATT 720
CAGGCTATTT ACGATAATAA GGTCGGATTA TTCAATTCAA TGAATGTTAA AGAGATGAGC 780
AAATAGTGCA TGCGTTATCT ACAGTGACTT CTATTTATTC TTCATCTATT CCCAATTCCA 840
ATTGAACTCT TCATTTCATT TAACTTTTTT CATTTTTTAA TTTCAGGTGA TTTCTGTTTT 900
TTTTACAAGT CTACCTGACG CCCGGGTTAT GTGCTAAGTA TTTTTTTTTG TGTATGTGGA 960
AAAAATCCCG CCCTAAGGCC AGCTTGGGAG AATGGCTTTT TATTATACAC CAGCAGCAGA 1020
TAACCCTGGA GATTAACGCG CGAAGGTTAT GCATAAAGGT ATACGCGGGT GGATTGAGAT 1080
AAAATGATGC CATTTCTTTG CATGTATATA GCGTCACACT TTCACTCTGC AAGCTGTCAA 1140
ACAGCTACCT GGAGGGCCAA AGTCCTACAT TATGAAGGTA ATCACACTCT TAAAAACAAA 1200
GGTTCGATGG TTCCATGTAG AACCTAGACC CA 1232