EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-05648 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr13:15031201-15032311 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE41MA0636.1chr13:15032011-15032021GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr13:15032011-15032021GTCACGTGAC-6.02
MITFMA0620.2chr13:15032007-15032025CATGGTCACGTGACCTAC+7.97
MITFMA0620.2chr13:15032007-15032025CATGGTCACGTGACCTAC-7.97
MNX1MA0707.1chr13:15032221-15032231TTTAATTACC-6.02
USF1MA0093.2chr13:15032011-15032022GTCACGTGACC+6.14
USF1MA0093.2chr13:15032010-15032021GGTCACGTGAC-6.14
USF2MA0526.2chr13:15032007-15032023CATGGTCACGTGACCT+6.87
USF2MA0526.2chr13:15032009-15032025TGGTCACGTGACCTAC-7.28
YY1MA0095.2chr13:15031994-15032006TCCGCCATTTTG-6.11
Enhancer Sequence
TTTATACATT TTCAAGCAAT AGGTTTTACT TTACCCATCT ATGATATTCT TCCCATGTGG 60
ATATTGACCA GCACAAGTGC TTCTCCTGTG TGTGACCCTG GATTAAATGC GAACATCAGC 120
CATAAACTCA GCAGCTCATG AAGCAGCATC TGCAGGTTTA GGTGTGTCAT TTGTTTATTT 180
GTTCAGCTCT ATGTCAAAGC CAAAGGCGAA TCTCTCTGTG CATTAATCAG GAGGATTTGA 240
GCTCATTTAT GAACCGCTCG CAGACACCGC TGTTTTAAAC TCCTAATCTG AGTGGACTGT 300
GCGTCTGCCG TGTCTCGCTC TTTGCCCTTG ACTGTGGATT GATCTGTGCT CAAAACGCTC 360
GGTACAGAGA TGCATCTGTT AGCGCTTTTG AAAGACAAAT GTCATTAAAC TGTCAACACA 420
CAGCCTTCGA TTTTAACTGA GGATAATCTG ATGACCAGAC AGGGCTTTTG TGTTGTCGTT 480
GCTAAAATTA CATACGAAAC AATATATGTA GGATATTTTC ATAAAAAATA ATAGTTCATG 540
CATTATCCCA AATGTTTTGA AGAATGTTCA AATCTAGCAA AATAAGCAAT TTTTACTAGT 600
GACACAGTGT GCCTTGTGTC ACCATGCATG CTAATAATAT CAGACAACCT CAATTTTTGG 660
TTTGGTATTG CAGAAAACAT GAAAACGACA AAGATAATTT GATATGTTGT GTGTTTTATT 720
AGACAGCACA TATTAGCAGC ATTATTATAG AGCTAAACTG TGTACTGTGT ACCTAAACTT 780
CGGAAGTACT ACATCCGCCA TTTTGTCATG GTCACGTGAC CTACCTGCAT CAATTGCGTC 840
ACTTTACTCT CATTCATAAA TTCGCTTCCC GGGCATCATG GGATAGCGCA GCATGCATGG 900
GATGCACACT CTAGAGCTGC GTCCCAAATC GCATACTTAT GCACTATTTT ACGCCATTTT 960
GTAGTATAAA TAGTGTAAGT AGTGTGTTCA CATTGAAAAC TCTCAAAATA ATAAGTGCAC 1020
TTTAATTACC CGGATGATGC ACTCATTCAG CCGCTAAAAT GAAGTGTGTA ATGATGGACA 1080
CTTCACGCAC TCAACGACCG CAGGTTTGCT 1110