EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-05598 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr13:12560283-12561332 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr13:12561034-12561046TTTGTTTACTTT-6.62
FOXP2MA0593.1chr13:12561034-12561045TTTGTTTACTT-6.62
Foxo1MA0480.1chr13:12560358-12560369TGCTGTTTACA+6.14
Tcf7MA0769.1chr13:12560979-12560991AAACATCAAAGC+6.14
Enhancer Sequence
AGCACAATAG CTCGCAGTAA AAGAAACATT AAACTACATG CGGAAAACGC AATACTTCTT 60
AGCTATGAAT GCTATTGCTG TTTACAAACG TCGCATAAAT CACAGGCCGG GTCTCCCGCC 120
GAAGGCTGAT TCATGTGCAG ATTTGTATCT ATTTGCCTTG TTCTTTAGAT TTATATTTGT 180
ACAGGCCAAT AATTATTCCA TTTTCTAAAA CGTCTCGCTC AATATCCGAG CACAGCGTGA 240
CCCCTAAATG CTTTCCTGGC TGTTATTAGA CTGCTGACAG ATGAGTTTCT ATTTCTTTTA 300
TGAGGCAAGG GGTGAGAAAC CGAATTGTCC GCGTGTCGGA AACGGCGCTC TGTCACACAC 360
ACTGTTAAGT GTGTTTGAGT GGATAGGATT GCTCGTGGCA GGAGTCCCTT GAGGGCTGGT 420
TTTGATGTGC TCGGATGGTT TCCAATAGCA ACCGACTGGC CAGTGAGCGG CTACATATGG 480
AGTGTGTGTG TGTGTGAGTC GGGATGTGCT TTGTTCACAC TTAAACTCTG ACACACGATT 540
CTCATTGGCG CTTCCTTTTT GCACGCTTGA TGTGTGAAGA GGCATTAATG AATGCATTTC 600
ACTCCGGGCT CCTTTTCTTC ACGTCAGAAA AAAAAGAGTT GGGGTTTCTC CGCTTCTCAG 660
TTTGTGGCTT TCAAACAAGT GATCAAACAT GCAAAGAAAC ATCAAAGCGT CTCCTGCATA 720
ATTAAAATAG TTGCTTTCTA TTTTTTCTCC ATTTGTTTAC TTTGAAATGT TTCATTTTTT 780
ATTCATTAAG AAGAAATAAA ACAATGTCGC TTCAAATGCT GTCAGATCAG AATTTCGATT 840
AGTCACGAGT CGTCTGTCTG TTAGGGAATA TGCAGGGTGG CAGTGATTCA TAACCTTAAT 900
CATGACGTGT AATTTCTGCA TTATAAGCAG AGCAAACAGC CCAACAAACC ATAATTTTGT 960
TATTGTTTTT CAGTCAGGTC TCTTAAAAGC ATCCCAACAA GCAAGTAATC ATATCCCAAC 1020
CATGTGCTAT TGGTTCAACC TAAAGTTTC 1049