EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-05597 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr13:12365835-12366812 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
MEOX2MA0706.1chr13:12366355-12366365AGTAATTAAC+6.02
RFX1MA0509.2chr13:12366204-12366220CGTTGCTATAGCAACT-6.46
RFX1MA0509.2chr13:12366204-12366220CGTTGCTATAGCAACT+6.47
RFX2MA0600.2chr13:12366204-12366220CGTTGCTATAGCAACT-6.91
RFX2MA0600.2chr13:12366204-12366220CGTTGCTATAGCAACT+6.95
RFX3MA0798.1chr13:12366204-12366220CGTTGCTATAGCAACT+6.4
RFX3MA0798.1chr13:12366204-12366220CGTTGCTATAGCAACT-6.77
RFX4MA0799.1chr13:12366204-12366220CGTTGCTATAGCAACT+6.31
RFX4MA0799.1chr13:12366204-12366220CGTTGCTATAGCAACT-6.51
RFX5MA0510.2chr13:12366204-12366220CGTTGCTATAGCAACT-7.22
RFX5MA0510.2chr13:12366204-12366220CGTTGCTATAGCAACT+7.28
SOX15MA1152.1chr13:12366637-12366647CTATTGTTTT+6.02
Enhancer Sequence
ATGGTTTTAC TTTAAGTGCC AAAGTTAAAG TTCATTTTGT GGTTTTATTA CAAAAAACAA 60
AGTTTAGCTA TGGTTACTGC AGTAAATAAA ACTATGGTTA ATATTAGAGT CAACTCTTAA 120
CGAGAGGACT GCACTAAACG AGCTCTGTGT TTGTTCTCAA ATTACTATGC TCATTACAAT 180
AAAAGCTAAT AAACATAATT AGACACTTAT TTTTACTTTA TTGGCACTAT TTAAAAATTA 240
AACATTATTA ATAGAAACAA ATATTAAACC ATGCACAACA AACACTATTA ACACTTCCGC 300
ACAAACAAGC AGACGCAGCA TAACGCATCT TGTGAGGTGG AGGCTCCGCC CATAGAACGA 360
ATCGCGCCCC GTTGCTATAG CAACTCTGGA ACTTTGGAAT GCGATTTCTC TGATTCTCTG 420
GATTTGTCTG TTGGCTCTCA AATATTTACA TGTGTATTTC TATGGTTGAC TCTTACGACA 480
CCCACACTGC AAGTTGCAAA TTGACTGTAC ATTTTACAGC AGTAATTAAC ATCACAGTAT 540
CTCAGTTATA CTGTACATCT CCCATGATGG AGAAGAAATG CAAAAAGAAC TTTTGGACGA 600
CACTTTTTGG CAATAAAAGA GCTAGTAAAA AATCCAGCAG TAACACTAGC TCCAGTGAAG 660
CTGAGAAGAA GGACCAGGGT GTGGATGCTG CCATGCTACA GTCTCTAAAA GATGCTGAGG 720
GTAAGTTACA AGACCATGTT ATGAGAATAG GAAATTTGTT CGTTTAATAC TACTGTGATT 780
CAGAAATTTT AATTCACCCT ATCTATTGTT TTTGTGCAAA AATGTTTTAT GTAGTGTAAT 840
TGTCACTCTT TACAATAGTA AAGTTCTGTT AGTTAATTTT AGTTAATGTA TTTGCTAAAA 900
CTAAGAATGA AAATTACAAC ATTCAATCAT AATTCAACAT GCCTGAATGC ATTATAAAAA 960
AAATCCAAAT TTGTGTT 977