EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-05549 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr13:10136971-10138543 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr13:10138193-10138210TGAACTAATTAATACTT+6.45
FOXD2MA0847.2chr13:10137829-10137842GCAAAGTAAACAA+6.39
FOXH1MA0479.1chr13:10138526-10138537TGTGGATTGGG-6.14
FOXK1MA0852.2chr13:10137831-10137845AAAGTAAACAAGAT+6.06
Foxa2MA0047.2chr13:10137829-10137841GCAAAGTAAACA-6.27
IRF1MA0050.2chr13:10137295-10137316TTTTAGTTTTTTTTTCTGTTT+6.4
Lhx3MA0135.1chr13:10138181-10138194GTATAATTAATTT-6.19
SOX21MA0866.1chr13:10137156-10137171AACAATAACATTGTC-6.67
Sox1MA0870.1chr13:10137156-10137171AACAATAACATTGTC+7.99
Enhancer Sequence
ATATTTTAAT AAAACAGACA TCGAAGTTCA TAATGGAGTA CATTTCACGA TATTTGGAAT 60
CACTGATAGG CTATTATCAG TTGCATGAAC TCAATTTATT ACTCAGTAAA ACATTCGAGT 120
TGATATGTTG TCTTTGGATA CTATAGTTCA TAATACCGAG ATGTTCGGAG TATTTGACCG 180
ATCAGAACAA TAACATTGTC AGCCTGTCAC TACTCGAATG ACTGAGCTGC TAGGTGTGAG 240
AGTGTATGAT ATAAAGAGAC AGAAGGGGAG GGAACATATT TTATGTCCTC TGTATTCCAG 300
CACATGTCTT GAGGCTCTTA GCATTTTTAG TTTTTTTTTC TGTTTGTGTT TGCATGTGTT 360
TATATTGCCT CGATTAGCCT CATTAGATCT GTTTAGCTGC AGAGCACACA CTAACAAACT 420
GAACATCATT AGAGCTCACA CCTCTCCATC TCTCTCTCTC TCTTCCACTT CTTCCATCCT 480
CTTCATCTCA GTCGTTTAGT ATCAGGTGCA TGATGTAACG TAACACAACA CTTTTGTATT 540
GTTGCCTTAT TGTTTTAATG TTGTGCAACC TATGCAAATC TACATTTTAT TTAAGAATCG 600
TATTAGCATA TGATTAATAT TAATATTTTA TTAGGTGACG TTACAATGAT CAAAACTATG 660
GCAACCATCG TTTCTGTGGG GTCACATGAC ATGTTTTTAA TTTTAGAGTA GAAACCAAAA 720
ATTTAGTTAC TTTAAATTGC ATTGTTAACT AATTCTTATC ACAAGTTTGA CGAATTTCCG 780
ACTCCAGCAA ACATTCGCAA AGTTCCCCGC AAGTTTGCGT GGTTCAAGGT TTCTCGCAAA 840
ATGGCATATT TAACTTGAGC AAAGTAAACA AGATAAAACG CAAAACATAT TTAATTATGT 900
ACATAAACAA GCTGCACTCT ATGAGTTTTG GTTTGTTTAG GGATTTAAAA CGCAGTTTTC 960
AAGGGTGCGC ATGCTCTATT AGCCTACTAC GCGCAACCTA ACGTGGTGCA ACGGTAATCG 1020
GGAATATATA ATTTGACGGA CAACAAAGAC AGAAACCGAG CGTAGCTTAG ATGCAATAAT 1080
CGTACATCAT TTTCATCATT TTATTTTATA ACCCCGCTAC CTGCGTGACG TCACTAACTA 1140
GTTTAATAGT TTTGTCCTAT AATGCATCGT CATTTTATCA TTAACCGACT GAAATAGCTC 1200
ATGTGTTGAG GTATAATTAA TTTGAACTAA TTAATACTTC TGACATTAAT ATCTCTGTAA 1260
GAATTCTGAA CAAAATATAG GGATTTATTA GCATGCAACC AACAAACAAT TCAGTGACCA 1320
GTGTCTAAGC TGAAAATAAA AGAGACTGGA ACGTGCTCCG TGACTCCACT GGACAAATGT 1380
GAACAATAAC AAAATATAGT GCTCTGTAAT CCTGTATCTA AAGTATAAAT CCTAAATGAA 1440
ATTCCATAAA AGGATTAGTA GAGTGTCACA GAGGAGCTGT TAAGAGTACC AAAGGTAATT 1500
TGTAACCTTA GCAACTACTG GAAATGGGGA TTATCACAGC CATGTGGGCT GCCTTTGTGG 1560
ATTGGGCCAG AG 1572