EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-05422 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr13:4610868-4611931 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr13:4611135-4611154TGTCCAGCAGGGGGCAGTA+8.1
CTCFLMA1102.1chr13:4611139-4611153CAGCAGGGGGCAGT+6.83
FOXE1MA1487.1chr13:4611041-4611056TGTAAAACAAACAAA+6.11
Foxd3MA0041.1chr13:4611045-4611057AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr13:4611049-4611061AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr13:4611053-4611065AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr13:4611057-4611069AAACAAACAAAC-6.32
IKZF1MA1508.1chr13:4611707-4611719TCTTCCTGTTTC-6.32
NFIL3MA0025.1chr13:4611330-4611341TTATGTAACGT+6.32
Nkx3-2MA0122.3chr13:4610986-4610999TTTAAGTGTTTTT-6.64
Enhancer Sequence
TTTGCAAATG TTCATTGGAA TGACGGCTTT AGGAAATGCC AAATCATCAA ACTATGTTTG 60
TAACGACACA ACTTGCGACC TAAGTTGGCT AACAATGGTT TTCAGAAAGC ACCCCAGATT 120
TAAGTGTTTT TTTCAGCATG GTTGTTTACA GTGCTGCAGC AATTAATTCT GCCTGTAAAA 180
CAAACAAACA AACAAACAAA CATAAAACAA GCAAGTCCAT CAAACTTTAG GAAAGCAAGA 240
TTCTGACTGC TTAAGAGTGT GAGAGGATGT CCAGCAGGGG GCAGTATTGT AATGACAGTA 300
AAGGTTAACC AAAGCGCCCT GTTGATGGGA GAATTCCTCA CACGACTGCA GTATCTTAAC 360
CGTCGTCCAG CTGATAAACT TATGAATGCG AATTCTTGAG CAAACAGGAA ACCCTTCCCT 420
GTGGAGTGAG TAGACGCTAT GTCCCCCACT GTACATCGTC ATTTATGTAA CGTTACATTG 480
GTCGTTTATT TCACTGTTTT GGCCACCGTC AAACGTCCTC TGGGAAACGG TTTGAATTTC 540
CGGTTCGTGT TCAATTCATG TACTGTGCTG TTAAGTGTGT AAGTGCACAT GATGTATAGT 600
GAGCCATTTA GGACGCTGTG ACAGTTTACT CTGTGTCTCC TGCCTCTGTC CCGTCGATGG 660
TAGACTACAG TTCGGATCCA GATCTCCACA TTTGTCTCAT TTATATAGTT CCTCATTACT 720
GCAGTCGCTC TGTTTAATGA GTCTGAGGGG GGCCGTGATG AGGTCTGAAG TCTGGATAAT 780
ACAGAATTGA GTAGTTTAAG GTGTCGTTCT GAGCTCTTAT GGTCAGGCTT TACTACTATT 840
CTTCCTGTTT CTATTGACTT AAAAACAAAA TGATGAAATA CCCAAGATAA GTATGGCCTT 900
AAGGGGACAG TTCACCCAAA AATGGGAATT TGCTCAACGT AAGTTGTTGC AAACCTTTCT 960
TTATTTTGTT GAACAAGATA GAAGATGTTT TGAAAAATGT TAGAAATAGG TAACAATTGA 1020
GTTCCACAGT ATTTGTTTTA CCTAATATAA AGTCAACAGT TAC 1063