EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-05416 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr13:4312168-4313004 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXE1MA1487.1chr13:4312815-4312830AATGTTTATTTAATA-6.38
NFYAMA0060.3chr13:4312384-4312395AACCAATCAGA+6.62
NFYBMA0502.1chr13:4312379-4312394AGACTAACCAATCAG+6.21
Enhancer Sequence
AATTATTGCA AAACAAAAAC GATAGCATAC AAAAATAGAC ACAGTATGCT ACTTACACTT 60
TTTACAGTAA TATCAAAGGA ACAAATCACA AGAGAAAATA AATAAATAAA TAAATAAATG 120
CACGGTATAA ATAAATATGA CCAAATATGT GCATTTCTTT TACATCATAT CTCTGAACCA 180
ATCACTGGCC AGAACGAACG CATCAAAGCG GAGACTAACC AATCAGAGAC TTCCTAAGCA 240
GTTCGTGGAG CGAGTTTTAC CTGAGTAAAG TATTTATTTG CATCTCTTCA AGTCTTCTGG 300
GTGTATTTTG ACTGGTGAGC CCTCGCAGTT TGGATATATC TTGTCGGATC CTCTTGGATG 360
ATAGAATGGA CTCCGGTGAC TGTCCTGAGA AGAACATTCA GTTTAGGGTG GACCATTTAT 420
TAACTGCGGT AGAAAATGAG CTTCAAGCTG GCAGCGAGAA AGGAGATCCG ACGGAAAGAG 480
AGCTTAAAGT CGCTTTGGAT GAAAATGAGC TTTGGCAGAA ATTCAAAGCA CTGACAAATG 540
AGATGATAGT GACCAAGAAT GGCAGGTATT TCTCTTTTTT TGCCAGATAA TATGTTGTAA 600
TTAACAGCAG AATTACATCT TTAAAATGTG CGGTTGTTAA CATAATCAAT GTTTATTTAA 660
TATGTTGATT GTTTGATTTG CTTATAGTGT TACAAAAGTG AGTGTTGAGT AAAAAAAAGT 720
TATATATTAA AATTTTAAGC CTATCTTTTG TCTATTTTAA TATAAAAACG CAAAAATAGC 780
ACATAGGCCT ACAGTACTTT CAGATTACTT TCCCTAAAAA GTAGCTACTT TTTATT 836