EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-05411 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr13:4237403-4238533 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXD11MA0908.1chr13:4237772-4237782GTCGTAAAAA+6.02
PAX3MA0780.1chr13:4238341-4238351TAATCGATTA+6.02
PAX3MA0780.1chr13:4238341-4238351TAATCGATTA-6.02
PAX7MA0680.1chr13:4238341-4238351TAATCGATTA+6.02
PAX7MA0680.1chr13:4238341-4238351TAATCGATTA-6.02
RUNX3MA0684.1chr13:4238189-4238199TTTGCGGTTT-6.02
Enhancer Sequence
CAACATTGTT CGCAGTCACT TAAAGAGCTT ATGTTGTTTT GAAGTCACAC TTACAAACCC 60
AATATTCAAA GTAGAGTGGT AACGTTAAAC AATACAGGAG TCATGTCACA AGTTATTACT 120
ATGCGAATGT GCGAATATAA AACCAACTTT ACCTCAATAC TGTATACAAT TAGTCAATGA 180
CGTTACATAC GTTTCTAGAA CACTTACATA TGGATCCATT GGTGGCACAA AATGCGGATC 240
TATTGGACCG TGATGCTCCA TCTGGTCGAA TCCAGGGATC CTTTGGAAAC CTGGTCCATC 300
GTCAAACTCA GAGGGGTGAA AGTTTGGAGG TCCTCCCCGA AAGTCCGGAG GACAGAAATC 360
TGGACCTCTG TCGTAAAAAT CAGGCGGGCC GAAGCATTGA GGTCTGTCAT CGAACTCCGG 420
AGGTCCACAC TCAAACTCCG GGTGAAAAAA CCGCGGACCT GGTGGTCTGT TCCTAAACTC 480
TGGATGAAAG CGTGGATCAC CGGGACCATC GAAAGGCGGT CTGAATTCAC CTCTATCGGG 540
AAAACCCATT GGGTGGAAAG GCTCATTCCC CATAAACCGC ACATCTCCTT CCATGGGATC 600
CATCATCATC ATTCTGGGTG GTCGCGGTCC GAAATCGGAA TGGGGTCCGG GGAACCTCGG 660
TCCGGGTGGG CCCATCGGGC GAAACCCGCC GCGTGGAGGA GGAGGTCTGG GTGGACGGGG 720
GCCTGGTCCT GTGGGACGCA TCCCAGGTGG TGGTCCAGTT CCTGGAGGTT GAGGTTGTCC 780
CTTTCGTTTG CGGTTTTTTC CCATTCCTCA ACAGTTACTA GTGAACGTTA GTGCTCTGTG 840
TGCAACAGCA GCTAACGTTA GCAGACCGGA TGAACCGAGC CACTGCTACG TTACTTTGCG 900
CGTGCTCACG TGACAATACA GTTTACATCG AATTAAATTA ATCGATTAAA CGTTAAAACT 960
GTTTTAATGC ATTTCATATA AATCATGAGC CAATCACCCA ACACTTAAAC GCAATAGCCC 1020
ACAGCATGGA CTCATTTCAT CTCACCACGA GCGCGAGCAG AAAACAATCC AAATGGCTAG 1080
CGGATGTGAT AAAGACGATT CAAAATAAAA GTCATCAAAA AGCAGAACAG 1130