EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-05364 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr13:2210802-2211788 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHA15(var.2)MA1472.1chr13:2210903-2210913AACAGCTGTT+6.02
BHLHA15(var.2)MA1472.1chr13:2210903-2210913AACAGCTGTT-6.02
FERD3LMA1485.1chr13:2210901-2210915GTAACAGCTGTTAC+7.58
FERD3LMA1485.1chr13:2210901-2210915GTAACAGCTGTTAC-7.58
Foxa2MA0047.2chr13:2211341-2211353TGTTTACATTGC-6.07
Foxd3MA0041.1chr13:2211739-2211751AAATAAACATTC+6.74
MSCMA0665.1chr13:2210903-2210913AACAGCTGTT+6.02
MSCMA0665.1chr13:2210903-2210913AACAGCTGTT-6.02
MYF6MA0667.1chr13:2210903-2210913AACAGCTGTT+6.02
MYF6MA0667.1chr13:2210903-2210913AACAGCTGTT-6.02
Tcf21MA0832.1chr13:2210901-2210915GTAACAGCTGTTAC+7.03
Tcf21MA0832.1chr13:2210901-2210915GTAACAGCTGTTAC-7.03
Enhancer Sequence
TGTGTCTGTC GTAAATAATG TATATGTTAT GGGTTATATG TATTAGACAT TGCTTTCTTT 60
CTTCGTGCTG TATTTAGGCT AATATGTAAA TACAGTAGAG TAACAGCTGT TACTATTCAG 120
ATTCTAGATA AACATCCGTG TAAAGCGGAC ACACACGAGC TCTTGCTGCA TGTTTAAATT 180
CTCAAGCATT AAAGCAGAGT TATAACAGGC TGAACTCGCG ACTCTGTGCT TTTTAATGCG 240
CATTTAAGTG TTTTCTGTCA GGCAGGTGCA TCACCATCAT CATCCTCATC CTCTTACCGC 300
ACGCCACACC GCAGGAGTCC CGGATCGCCC TGTATTTACT GCCCGACGCC TCCTTCTGAA 360
GCCTCCGCAG AATCTCCTCC ATCGCGCTGA AGATTTCTGA TGATTTTTGG GCTGAAAATG 420
AGGATTTCAG GCCTCCTGTT TAAAGCTCAG CATCTCTACA GTACAGATGA TTCACTTTAA 480
CAACACTCAC ACGTCACGCG CGCGTCACTT ATTATTATCA GCAGCGGGAA AGCCGCTAAT 540
GTTTACATTG CTAAACAATG CTTCTGACTC AATTAAAGTG AATTTTATCG GGATTCTAGT 600
GTAAGCATCT GATTTGTGAG GTGGGTGCGC AGCTCTTGTG TCCAGCTACT TCCCGTCCGC 660
GAATTAAGGT ACGAAAGCTA CTATGGTAAA GGGTGAAGTA CTTAATATTC ATAAGCCACG 720
CCTTCGCTGT TGGAAGGAAA TAACACCGCG TCACTGTAAT CTGATTAATA TTCAACGACT 780
TCCACAGCTG GCATTGGAGG AATGCCCAGC AAATCTAATC TGATCTTATT AATATTCATA 840
AAGAACTCAT CTTCGCCGTA GTATAAGCCG GAATACTGTA TTATTATCTC CGTCTGTGAG 900
AAAAAAAATA ATGTGTTATT AAATATAGAC GAGGTGTAAA TAAACATTCA ATGGCAAAAT 960
CTAAAGTAGT GTTTTAACTA TTTTTC 986