EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-05143 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr12:43941196-43942024 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr12:43941959-43941980CTTCACTTTCACTTTTTTTAC+7.37
NFYAMA0060.3chr12:43941449-43941460TCTGATTGGCT-6.32
PRDM1MA0508.2chr12:43941961-43941971TCACTTTCAC+6.02
SP4MA0685.1chr12:43941410-43941427AAAACCCCGCCCCTTTC+6.17
Enhancer Sequence
CGGATGTGTG TATTATTGCT CTTAAAAACG ATTATTAATG TAAATAAACA GAAGGTCGGA 60
TTTAAAACAG CCAAAACATG ACGATCGTTT AGTCCAAGTT ATGGGAAAAA TCCTTTTATA 120
ATAGCTATGA AATGAACCTC GCACTTACAT TGTTTCAGCA TTCATTTGCT AATAAGTCAA 180
TCCAGAATTT ATTCAACGTG AGCGCGCTTT CAACAAAACC CCGCCCCTTT CAGCTGGGAT 240
GAAAACAAAA TTATCTGATT GGCTGTTACA TTGATAAACT CAACAGAAAC GAGTATGATT 300
GGTTTTAAGG CTCATCTGAC GCACCATGAC AACCGGTAAA GTGTTGTTTT GCACTGTGCA 360
GCGGTATATT TACCAACATC CTAAATGTAT GCGGAATTTC TGTTAATTTT GGTATATTTG 420
GCCACAAGTC TACTTTAATT TCCGACGCTA ATGCTACAGG ACAAGATTCA AATACGGAAA 480
AAAGAAGTGC CTGCATTAAA TGAATGGGTT TTTATCATTA GAAGCCAAAC AAACTCCTCC 540
AACGTTACAA CCGTTTCCAA CCATTATAGT GGCGTGAACT GCTTACAGGT AAGCGATTTT 600
GCTTATCTAA AAGCCCCTTG ATTTTAAAAA TGATTTTAAA AATGTTGATC TTGTTGTGAT 660
ACCTGTAAAT ATATTTTGGA TTGTTTACTT CATGAATGAT ATTTCATATC TAAACTATGA 720
CGGGCAAAAC AATCGTGAAA TGCTTTGAAT TCACTCCAGT TTACTTCACT TTCACTTTTT 780
TTACGTCAGA GCTTGCGGAT TAATCCTCAA AGTATGTTGG AACAAAAT 828