EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-05043 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr12:38374862-38377357 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DMRT3MA0610.1chr12:38377056-38377067TTTGATACATT-6.02
IRF8MA0652.1chr12:38377183-38377197AGTTTCAGTTTCTT-6.03
IRF9MA0653.1chr12:38377183-38377198AGTTTCAGTTTCTTA-6.05
POU4F1MA0790.1chr12:38375755-38375769AATAAATTATTTAT-6.02
POU4F3MA0791.1chr12:38375753-38375769TTAATAAATTATTTAT-6.03
SOX15MA1152.1chr12:38376842-38376852AAAACAATAG-6.02
TCF3MA0522.2chr12:38375259-38375269AACACCTGCT+6.02
ZNF384MA1125.1chr12:38376142-38376154AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr12:38374889-38374901TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr12:38374890-38374902TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr12:38374928-38374940TTTTTTTTTAAA-7.22
Enhancer Sequence
TCCTCCACTT GTTTCAAAAT AGTTCGATTT TTTTTTTTTT GTTCCATTAA ACATCAAACT 60
TGTATATTTT TTTTTAAAGA AATTTGGTTA AAATATGGAT GTCAATAGTT ACAGGTTTCT 120
AACATTCTTC AAAATATCTG CTTTAGTGTT CAACAGAAAT TCTAACTGGT TAAAAACACA 180
TAGAGTAATG GTGGCAGAAT AGTAAACTAT CCTTTTAAAT ATTTTATTCT GAGACTTATT 240
TATATGTGTC TTGTCTTTTG CCATATTGTC TTTTTAGCTC AGATTTTGAT GGACCTGGAA 300
TGCGACTAAA GTTACTCTTA AGTCAAGAAC CAAATAAAGC ACAGATGTGG AGCGATCTGC 360
AGCTAAACTA CCTGGAGGAA AGGAACCTTT AGGTAAAAAC ACCTGCTTTA TTTAGATCTG 420
AAGTATTTTA TTTGGCATAG AGTATTATTT TTTATTCTTA TTCTAATTTT ATTTTATGTA 480
TATACTGAAT AGAAGCCATT TAAATTTCAC AACAAATGAT TGAATATAAA ATATCATCTA 540
GATGTTTTAT TTTTCATTGT CTTAAACAGG GGTGCTCAAC CCTGTTGCTG GAGATCGACC 600
TTTCTGCAGA GTTTAGCTCC AACCCTGATC AAACATCAAC TAACCAACTA AATAGTATCT 660
GAAGGAGCAC TTGGTAAATA AAGACAGGTG TTCTTGATCA AGGTTGCAGG TGAGCTCTGC 720
GGAAAAGTAG ATCTCCAGGA ACAGGGTTGA GCACCCCTGA TCTAAATGCT CAAAAATGCT 780
GTTTCAGAGG CGAGGTTGGA TGTAGTTCAG AAATAGATTC ATTAGGATCA ATGCTTAAAG 840
TAAACGTTTA CTTCTCTCTG TAGACCAAAC ATGCTTAGTA TCCCTCACAT TTTAATAAAT 900
TATTTATTTT GGTTACTTTT ACATCTATAT ATGGTTAAGC AAGTATTTAA TAAATAAAAT 960
TATAGTTTTT TTAGATTATT TAGATTTTGT TTTTTTTACA GTATAGGTGA ACATACTACC 1020
TTGATGTCCA ACAAAGGCTG CACTAGAGCT CATTTGATGG CACATATTCT GTCCTGTCTA 1080
CATCTCTGAC GAAGTGCTTC GACATCAGTG AGTAATAAAT CTTCATATTA TCATGCATAC 1140
AGGATTTCTG TAAGCCTATC TTTAATGTTA GTTTGTAATC AGCAGTGACT GTTTTAAAAA 1200
ATTTGGGATT TAAATTGATG CTGTGCACAG TAACGTCATG ATGATTTAAT TTGAGGAAAT 1260
GTCACTGGAG AGGTGTTCGC AAAAAAAAAA AATAATAAAT TGAACAAAAT GACTCTATTA 1320
AAGATTTATT TGTCTCACTG ACATGCCATC ACTGCATATT GAAATACAGT AATACGAATT 1380
GACCGCAAAA TATTACCACA AACATTTCAT GAAGTAGATT GCTTGACTAC TGTACAGTTC 1440
TTTGCTCAAC TTTAACACAT TTTGTCGTGT CGCTGTGCCT CTCGGCAGAT TTTGCCAAAA 1500
ATGAATGCTT AGTGATTATT TTGTTTTATA CGAACCAAAG GTCAGCAACT CATCATTAGC 1560
ATTATTTTTT AAAAATCACC TACGGCTTTC ATGTCCTCTA ACGCAATCTT GTCCGTAAGT 1620
TAGAAGTGAA TTTTCACATG TTAAAAGCTT AAAAGTACTT GATTAACATT AGTCACGTTA 1680
AATTAGATTA TTTTATTTAT TTATTTTAAA TATGTAGCCT CTTAAGGTCA GAATGAACTG 1740
TGTTCACCCC TCTTAAATCG GTGGAAGCAC TAGTAGTGTG ATCATGGAAT TAGATATTCA 1800
AGCTATACAG AGTCAGACAT TATGTGAAGA CTAGTTTATA GTTAAGACTA GTTAATGACT 1860
AGTTTTGACT TGACGGATCT TTTCCCCATT AACGTTAGTG TAATTGTAAA TTGACAACAA 1920
ACAATTTTGC CAACAAAAAT GATTTAAAAA AAACAGTGTT TTATATATAA ATATATATAT 1980
AAAACAATAG TGCGGTGTTT GGTTTCTGAA TGAATGAAAT AATTTGAGGC ATGATTAGCT 2040
TTTACTCCAG TGATTGATTT TGCTTGTCAT TTTTGCAGGA TCATCAGAAG TGCTGCTGCC 2100
CTTTTTCACT GTCCCTTTTC CACAACATCA TTTGGCCTTC ATCATTTCCT GTCTTGTAGC 2160
AGTATTTTCA CCTGTTTTTT AAATTTTAAT GCTTTTTGAT ACATTAATTG TTGACTGGTT 2220
TTAATTATCA ATTGTTCATT AGTGTTCTGT TGCTTTGTTA TATTGAATAA TTGCTACTGT 2280
TTCAGTAGGG TTTACACAAT AAACTTTTAT TGTGAAGTTA AAGTTTCAGT TTCTTAATTT 2340
TTCTTGTATT TCTTAAACAG TTCAAATAAT ATTTGTGCAA TTTTTGAAAT TTTTTTGCTC 2400
ATTGCTCATT ATAAAGTAGC ACTATTAAAT ACAATAAAAT AACATTTAAT AACTGTAAAA 2460
TACTATACAG TAATAATGAA AGTAACGTTA AAATA 2495