EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-04988 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr12:36092884-36094233 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DUX4MA0468.1chr12:36094214-36094225TGATTAAATTA-6.62
DUXAMA0884.1chr12:36094213-36094226CTGATTAAATTAT-6.62
Hmx2MA0897.1chr12:36092959-36092976AATTGTTAATTGCTTTT-6.98
Hmx3MA0898.1chr12:36092959-36092976AATTGTTAATTGCTTTT-6.54
RARA(var.2)MA0730.1chr12:36093015-36093032TGACCTTGTCATGACCC-7.21
Rarb(var.2)MA0858.1chr12:36093015-36093032TGACCTTGTCATGACCC-6.19
Enhancer Sequence
ATGAATTGTA TGTCCATTTT ATCTAAACAC TTTTCATGAT GTATAACAAT ATACATATAA 60
AAGCAGCTTG ATGCTAATTG TTAATTGCTT TTAAGGGTAA AAGGTATGTG TCTTTCTCTA 120
ATTCCATTAA CTGACCTTGT CATGACCCAA AGGTTATACT CTTCTTCAAT TACCAGTCAT 180
TACAATCTTA ATTATCTCCT CACTACACAC ACAACTCCCT AGAGGTGGAC AGTGTCCTGT 240
TTGTCCAATC AGAAACGGCT ACCTGTGCAT CAATAGCCCA ATCTTACACC TCCACCTCTC 300
ACCTTCGACA TGTGAATCAG TGGACGTGTG GAGAGGCAAA TAGAGTAATT TGTCAGCTTT 360
CACATACGGC TCATGCTCAG AACAAAGGAT AAAATCTGCT GATTAAAAAC AAACGCTCTT 420
CATAATGCGA GTGTTATTCA GTAAAAACGC GATGTAGGTT TATTAGCTGC TCAGATTTTG 480
CGCATCTCTA AAGAAAACAT TTTTCTTCTT CTGGTAAATG TTACATGACA CCACTCGGCA 540
TGCATTAATA ATATGAATAC AAGTGATTAT AAAAGCTTAC CTGAGTCAAA ATGAGAGCTC 600
AGCGCAAAAC TGGGGTTGAA AAACGACGCA GACATGACCA ACAGTGTTAC AGTCCCTGAC 660
ATACTGAAGA TAACGCGAAG TCCAGCAACG GTGTCTCTGC TGTTAAATAC AAGAGTTTAT 720
TTTCTGTTCA AACACGTCGT TCTCGCGCTC CTCCATGTCA CGGAGATCAA ACACGGGAAT 780
AGCTGGATGA ATCCACTGGT TTTGCAGTGC ATTATCTTCA AGACGCGTCT CACCGCAAGC 840
CACTGCCGAG TTGATGCGAG TCTTCTCTGG TCATTCTCGT TTGTAGGGTC TCTGCGGTGG 900
GCGCTTCTGC TTCTCTGCAC CAAACGACGA GCGCACTCCT TGTGCGTTTG GCTGAGGAGG 960
TTTTAACAGA AGGAAATTCT GTCAGTGCTT TCCTTCTAAT GTTTCAAGCC CCGAATGAGC 1020
AGTTTGTTAA TAAGCCTGAT GGGAGCTGTT CAGTGCTGAA CGACACAGCG CCATCTTGCT 1080
CTTCGCGATT CCTCCACAGA CTCTCAAGCG GACTGATTCT GCTGGAATGG GGAGGAGATT 1140
GCGCCACTAG CGCAGCTGGA AGTGACGCTA ACATTTAACG CGCTCGATGA AAATACATTA 1200
TCTAATTATT TGCTGCATTA CAGTTTGCGG AACTGTGGCT CACAACTTTT ATGTTGACGA 1260
GTGTCCTGAG GAAACAGCTG GATACTTGCA TAATTGCGGA TTATTAGGGA ATGGTTTAGA 1320
CTCTGAACTC TGATTAAATT ATTAAAGCT 1349