EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-04981 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr12:35847933-35849921 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArxMA0874.1chr12:35849154-35849171GTCTGTTAATTAGTGTA+6.3
IRF1MA0050.2chr12:35848782-35848803TAACAGAAAAAGAAAGCAAAA-6.73
LHX2MA0700.1chr12:35849158-35849168GTTAATTAGT-6.02
Lhx3MA0135.1chr12:35848393-35848406AAATTAATTTATC+6.17
Lhx3MA0135.1chr12:35848390-35848403GGAAAATTAATTT-6
Enhancer Sequence
CTCCAAGACC GAGTTTGGAC ACCCCTGGAT TACGGGATGA AAGACCCTCA CAAGAGGATG 60
CTCATACTTG TGGTCAGTGG TCTCTGAACG TCTGAAAGCT TGCATCTTAC CATACAGGCG 120
CCGCTAAATC TGAATCACTA GACGTCAACT GAATCAATCG AAGTCACTTG ACAAAATATA 180
GGAACATGAC CACATTTCAG TGATGCAAAT ATAATTAAAA CCTGCCATTT TTCAAGTCTT 240
TCTTACTACT GTACATCTAC AGACTATGAC GAGATTACCG CCTTTTTGTA TTTATGATGC 300
GCTGCATTTG CTTTTTCTTC CTTCATCAAA CTTCTCTCTA GTGATTGCTT TCGCTGTGAA 360
GACTGACAGT TGCAGGAGCC AATCATTTTC TAGAGTGAGG AATAGCCTAT AGGCTGAAAC 420
TACTACACAA GCATGTCGAT TCAGTTTGGG GATATTAGGA AAATTAATTT ATCAAATATG 480
TATAAATAAA ATGTTTGATG ACGACAATAC AAAGTTTTTT ATTCTATGCT AATTTAATAA 540
TTTTAAAAGG AACACGATAG ATGGTTTCGG TTTTTTAACG AACACATTGA GAATGATTCA 600
GTTGGATTTT AAAAACTAAA AATAAGACGA AAGCTATAAC GTTAAAGTTA TATACGAAAA 660
GTTATATAAG ACGAAAAGTT GTAGACACAC GATAAAGAAA GCATGCTTAA TTTGATTTAC 720
AGAGTTTAAC TGCTTCACTT AACGTTGCTT GTAATTAAAA CTGGGAATTA ACAGTAAACA 780
TTATGTACAG TATTGTTCTG GCATATGTTC TCTTCTGAGT AGCCAACCAA TAAAAAGAAG 840
GAAACATTCT AACAGAAAAA GAAAGCAAAA ATGATTCGTT TGTCACCATG ATCAACTCTG 900
AATAAATCTT TTTAGCAGGG ATTCAAAAGA TTCACGTGAT TGTGGTGAAT CAATACATCC 960
ATTAACCACA GTAATACACT GATGCGTTTT TTTGCATTGT AAAATTATAA TTAACAAGAT 1020
TATTTTTAAT ATTTATTCAC TCACACACCC CTTGCCTTGA TCCACAGCCG CCGACAAATC 1080
TCTCTCCGCA GAAACTATGG AAACCAACCA CAAAGTTTCA CTGAAACTGC CACAACTTCA 1140
GAGCGTTTAC TACATGGAAG CATTTTTTTG CCGAATGATA GTCTTTTTAT AATACACTTC 1200
TTTGTAGATA ACATTGTAAA CGTCTGTTAA TTAGTGTATT TGAAAGGTGT GGTATGTGAT 1260
TTTGTGAACT GAAGTGCTTT TGTTGATGTC GCTCGGCAAC AAGCGTCGTA AGTTTGTGTG 1320
AAGTGTTTCT AGGAGGGCGT AAACTGACGT CTGAAGACAC TTGAATCGAA CAATTTGCAT 1380
TATTTATAAT CCCTAACCCA TACACCGTTT TAAAAACCAC GTATTTGTGT GGGTTTTTAG 1440
ATCATTAAGA TGACTGGGGT AAAATGTTTA AGGGGTGAAG CTGGAGATTC AGTACTCGAA 1500
TGGTCTTGTA GAGGAGAGGA TGGAGATTTT AACATTTGTG GACGCTGTCA GACTTGTATC 1560
CTTTCTGAAC AACTACACCA CATCGCTGAG TGGATAAACA AGGCTGGATG GGATTCTCGG 1620
AAGAGGTTTA TTACTGGTAT CCTGGTGCGG TGCCAAAGTC TTCAAATCCT AGAGAGTCTT 1680
CAAAGTGTTT TGCAAGTGAC TTCAGGGAAA GATTATACTT ATGCCAGGTC CAGAGCCCTG 1740
CCAGAGGACA CCATGTGGAG CATGGATGGA GGAGGTCCGG ATGGAAAAAT ACATGGACTT 1800
GATGTACTGG AGACGTGGGA ATGGTTCAGG AAGAGCCCAG ATTGGACCAA GTCTAAGTAT 1860
GTGCTGGGGC TCTTGACATT ATGTGACACC CATCTTTTGC ACATGCTAGG GAATCTTGTG 1920
CGTGTCCTGA TCATTTGGGA GAAACACAGA TTTTTGCAAT TCAGTAATTC TGGTAAGAAT 1980
GCACATAT 1988