EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-04966 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr12:35018263-35019635 
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DMRT3MA0610.1chr12:35019287-35019298TTTGATACATT-6.02
HOXD9MA0913.2chr12:35019126-35019136GCAATAAAAC+6.02
Enhancer Sequence
AAAAAAAACA CTAGAAATAC ACTTTCTTTT TGCAATTTTG CAGCTCTGTA ATGGTCAAAC 60
AGCAACATTA GGCTATTCAC TGAGCTGAAC ATGCGAAAAG CATAATAACT TTCCGTATTA 120
TACATTTATT TAGGTCTTTT TTTGTGGATT ATTTTGAGGA TTGTTTTGTC AGACTCTGTA 180
TTGTTAGAGC TTAAATTATC CACATCATCA CATAAATGAC TAGTTACTTT TACTTGTTAT 240
TAGTTGAAAT AAATCATTTG TATTGTGTTG CTTTCAGGAC TGCACCGAGG CAGCAGTGAC 300
GCCCAGTTTG TTGGCTGCTG GTTGATCGGT GCGGCGCGCG CTTGGAGACG TAGCGCTGCG 360
CGTGGGTCGC TACGAGGGGT GTGTGTGTGT GCGCGCGTCC ATGACACTAC TCCACAACAC 420
CGATTAGACA TCATCACACA TCAACCTACG GAGGGTCACG GAGCATCGCA TCACTCATCC 480
TGGAAGGCAG CGCTCTTAAA CGGCGTCCGC GCAAATTTGT GCCATTCAAC CCATTTGAAC 540
AGCGCTCGCT CGCGGATACA CCCTGCTCAG GAGGTGGCTT AACACCGGAC AATGACACTG 600
AGCTATAGCC GGAGATAGGG ATGGATACAA GAGTGTGGAG GATGCTCGCC CTGCTCGGTG 660
TGTTTGCAGT TTTCCTGGAG GTAAGAATTG CGCCTTTAAT AGCGTAAAGC AAAAACGCCT 720
AAACTGGCCG TTTTGCTAAC ACCATGTGTG GTTTTGCGTG TTGTATCTGT AGACCATTGC 780
TTTGTGCAGG TAATATTAAT GCTGCATGAT TTTAAAGTGC GCCCTTTGGT CAAATCTACT 840
TCAGCATCTC AGTCTGTCAT TGTGCAATAA AACACTCACA TGCTGTTTAA TGGATTCAGG 900
CAAAGCCACC TCCCTCTAAT AGAGGATCTG ACATGCTGTA GGGAGGAAAT GTCGCTTAAA 960
TGAAACACGT TAGACACGGG GAATTATTAG ATGTTTGAGT TCAGTTTATC ATTATTATAA 1020
TTTGTTTGAT ACATTTTGTA TGCATAAATG TCTAGAGCTT TCAAACCACA GGGATTGAGA 1080
GGCTAAAATA CAACACATTG ACCCATATTT GGCTCAAAGA TTAATGAGTT TGATGAGTGT 1140
GCTAGAATAA AATGATCGAC CACACACTTA ATGGTATTTC AGGGGATTTG CAGAAGAATT 1200
CAGCATTAGG ACTGTTTGAA AGCAATGCCT GTTTTCTTGG GTACTGGAGT ATATTTACAC 1260
ACAAGAGTCC TTAAACTCAG ACCAGCAAAG AAGACAAAGA AACATGCAGT TGTGGAAAAA 1320
AAAAAATCCA GCATATGTAT GTCTATACAT AGTGCTCAGC ATAATTGAGT AC 1372