EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-04935 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr12:34134360-34135166 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr12:34135023-34135036AAATTAATTAGCT+6.15
SIX2MA1119.1chr12:34134873-34134889TTATCAAGTTTCAGCA-6.04
YY2MA0748.1chr12:34134424-34134435GTCCGCCATTT+6.14
ZNF24MA1124.1chr12:34134723-34134736GAATGAATGAATC-6.74
Enhancer Sequence
ACGGTGGAGT GGGCGGAGCC TCGTGAATGA CGGTTATTTT TTTCAAACGA GGAAGTGAAG 60
TCAAGTCCGC CATTTCATCT TCTTTTTATC GGGTAAGTTA TTATTTTAAA ATCATATTTG 120
TGAGATATTT GTCGTCAGGT AATGTTTTAT TGTTAGAAAA GCCCCTGTTT TGAATAGTAA 180
TAAAACTGTA ACTTATATGT GGATAATATG GCTAAAAACG GCTAAGAATG ATGGCCGCCG 240
TCAGTTCAGT AACGTTAATC TGTTAAGTTG ATTGTGCTCG GGGTTTTAAC AAATTCATTT 300
AAGTTACAAT TGAAATGAAC AATAAGACGT GTTATATGAA GAACAGCGTC GAAACGGGAG 360
CTTGAATGAA TGAATCATAT GCTGTCCGTT TTATACAGTT GTAATAGGTG CCGAGTTCTG 420
CTTTTGTACT GGTTTTAGCT CAAACACCGA ACGAACAGTC TCTTTTTGGT AACGTTAATC 480
CTAATGATCT TGATTTGCTT GTTAATGTGT GTTTTATCAA GTTTCAGCAA AAGTTTGCAG 540
AGTAACGTTA TGTGGTTCAT TCTGGCCACT GTTGAGACTG GTCTGCATTA AAAAATTTTT 600
TTAGAGCCAA AACATTTTTA AAAAATTCAA AGTTGAAACA TGATGTTAAA TGACTTATGA 660
AGGAAATTAA TTAGCTAAAA AAGAAGGCTA AGTGTGTTAT GAAATATTAA ACCTTGTTAA 720
AAAAATAAAA TCAATTGTGT TAAATAAGCT TAAAATCCAT ATCTTATGTT TTATGTTACT 780
TCAAAACAGC CTGGAAATTA AATTGC 806