EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-04852 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr12:30417517-30420606 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr12:30419998-30420011AAATTAATTTTTC+6.11
POU1F1MA0784.1chr12:30418368-30418382AATATGTAAATTAG+7.28
POU2F1MA0785.1chr12:30418368-30418380AATATGTAAATT+6.02
POU2F1MA0785.1chr12:30420176-30420188AATATGTAAATT+6.02
POU3F1MA0786.1chr12:30418369-30418381ATATGTAAATTA+6.02
POU3F2MA0787.1chr12:30418369-30418381ATATGTAAATTA+6.02
POU3F3MA0788.1chr12:30419667-30419680AATATGCTAATGT+6.12
POU3F3MA0788.1chr12:30418368-30418381AATATGTAAATTA+6.22
Enhancer Sequence
GAGGCAAGGT TATTATAGTT AACAAAAACA AACAACAAAT GTATGAATTC ACTAATGTTG 60
ATCCTGGACC ATCAAATTTA TAACTTCACC AATGTTGATC CTGGACCATC AAATATATAA 120
CTCCGCCAAT GTTGATCCTG GACCATCAAA TATTTGAAGT CACTAATGTT GATCCTGGAC 180
CATCAAATAT ATAAATTAGC TAATGTTAAT CCTGGACCAT GAAATATATA AATTCACCAA 240
TGTTGATCCT GGACCATTAA ATCTATGAAT TCGCTAATGT TGATCCTGGT CCATCAATTT 300
TATAAATTAT CCAATGTTGA TCCTGGACCG AAAAATATAT AAAAACACCA ATGTTGATCC 360
TGGACCATTA AATATATGAA TTTGCTAATG TTAATCCTGG ACCATCAAAT ATTTGACTTC 420
GCTAATGTTG ATCCTGGACC ATCAAATATA TAAATTCACC AATGTTGATC CTTGACCATC 480
AAATATATGA ATTCGCTAAT GTTGATCCTG GTCCATCAAT TTTATAAATT CTCCAATGTT 540
GATCCTGGAC CGAAAAATAT ATAAAAACAC CAATGTTGAT CCTGGACCAT TAAATATATG 600
AATTTGCTAA TGTTAATCCT GGACCATCAA ATATTTGACT TCGCTAATGT TGATCCTGGA 660
CCATCAAATA TATAAATTCA CCAATGTTGA TCCTTGACCA TCAAATATAT GAATTCGCTA 720
ATGTTGATCC TGGACCATCA AATATATAAA TTCACTAATG TTAATCCTGG ACCGTCAAAT 780
ATATAAATTA GCTAATGTTG ATCCTGGACC ATCAAATATA TGAATTCACT AATGTTTATC 840
CTGGACCATC AAATATGTAA ATTAGCTAAT GTTGATCCTG GACCATCAAA TATATAAATT 900
CACTAATGTT AATCCTGGAC CATCAAATAT ATAACTCCGC CAATGTTGAT CCTGGACCAT 960
CAAATATTTG AAGTCACTAA TGTTGATCCT GGACCATCAA ATATATGAAT TTGCTAATGT 1020
TAATCCTGGA CCATCAAATA TTTGACTTCG CTAATGTTGA TCCTGGACCA TCAAATATAT 1080
GAATTCACTA ATGTTGATCC TGGACCATCA AATTTATAAC TTCACCAATG TTGATCCTGG 1140
ACCATCAAAT ATATAACTCC GCCAATGTTG ATCCTGGACC ATCAAATATT TGAAGTCACT 1200
AATGTTGATC CTGGACCATC AAATATATAA ATTAGCTAAT GTTAATCCTG GACCATGAAA 1260
TATATAAATT CACCAATGTT GATCCTGGAC CATTAAATCT ATGAATTCGC TAATGTTGAT 1320
CCTGGTCCAT CAATTTTATA AATTCTCCAA TGTTGATCCT GGACCGAAAA ATATATAAAA 1380
ACACCAATGT TGATCCTGGA CCATTAAATA TATGAATTTG CTAATGTTAA TCCTGGACCA 1440
TCAAATATAT AAATTCACCA ATGTTGATCC TTGACCATCA AATATATGAA TTCGCTAATG 1500
TTGATCCTGG ACCATCAAAT ATATAAATTC ACTAATGTTA ATCCTGGACC GTCAAATATA 1560
TAAATTAGCT AATGTTGATC CTGGACCATC AAATATATGA ATTCNNNNNN NNNNNNNNNN 1620
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 1680
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNGAATTC ACAAATGTTG ATCCTGGACC ATCAAATATA 1740
TAAATTCACA AATTTTTATC CTGGACCATC AAATATATGA ACTTGCTAAT GTTGGTCCTG 1800
GACCATCAAA TATTTGAATT CACAAAAATG TTGATCCTGG ACCTTCAAAT ATATAAATTC 1860
ACAAATTTTA ATCCTGGACC ATCAAATATA TAAGTTCATT ATTGTTGATA CTGGACCATC 1920
AAGTTTATAA ATTCATTAAT GTTGATCCTG GACCATCAAA TATATAAATT CACCAATGTT 1980
GATCCTGGAC TATCAAATAT ATAAATTCAC CAATGCTGAT CCCGGACCAT CAAATTTATA 2040
AGTTTGTCAA TGTTGATCCT TGACTTTCAA ATTTATAAAT TAGCTAATGT TGATCCTGGA 2100
CCATAAAATT TTAAATTCGC TAATGTTAAT CCTGGACCAT CAAATATTTA AATATGCTAA 2160
TGTTGATCCT GGACCATCAA ATATTTAACT TCACTAATGT TGATCCTGGA CCATCAAATA 2220
TATAAATTCG GTGATGTTGA TCCTGGACCA TCAAATTTAT AAGCTTGCTA ATGTTGAATC 2280
TGGCCATCAA ATATTTAAAT TCACTAAAGT TGATCCTGGA CCATCAAATA TCTAAATTCA 2340
CTAATGATGA TCCTGGACCA TCTAATATAT AAATTTGCTA ATGTTGATCC TGGACCATCA 2400
AATATATAAG TTCATTATTG TTGATCCTGG ACCATCAAAT AAATGAATCT GCTAATGTTG 2460
ATCCTGGACC ATCAAATATA TAAATTAATT TTTCTCGATC CTGGACCATC AAATTTATAA 2520
GCTTGCTAAT GTTGATCCTG AACCATCAAA TATTTGAAGA CACTAATGTT GATCTTGGAC 2580
CATCAAATAT TTAAATTCAC TAATGTTGAT CCTGGACCAT CAAATATTTA AATTCACTAA 2640
TGTTGATCCT AAACCATCAA ATATGTAAAT TCACTAATGT TGATCCTGGA CCATCAAATA 2700
TTTGAAGTCA CTAATGTTGA TCCTGGACCA TCAAATATTT AAATTTACTA ATGTTGATCC 2760
TGGACCATCA AATACATTAA TTCGGTGATG TTGATCCTGG ACCATCAAAT ATTTGAAGTC 2820
TCTAATGTTG ATCCTGGACC ATCAAATATA TAAATTCACT AATGTTGATC CTGGACCATC 2880
AAATAAATAA ATTCGCTAAT GTTGATCCTG GACCATCAAA TATATAAATT CTGTGATGTT 2940
GATCCTGGAC CATCAAATAT ATAAATTCAC TAATGTTGAT CCTGGACCAT CAAAATGATT 3000
AATTTACTAA TGTTGATCCT GGACCATCAA ATATATGAAT ACGCTAAAGC TGATCCAGAA 3060
CCATTAAATA CATAAATTTC TTAATGTTG 3089