EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-04828 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr12:29456753-29458445 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr12:29458128-29458139TTAATTAATAT-6.62
Nkx3-2MA0122.3chr12:29458343-29458356AAAAACACTTAAA+6.64
ONECUT2MA0756.1chr12:29456971-29456985TTTATCGATTTATA-6.01
Enhancer Sequence
TTACTCAAAA TGAGTTAATT TTACAAGAAA CGGTGAAAGA CACCCCCTTG TGTTGGTGAA 60
AATGATCAGA GTTGTATTCT ACGTCGTTAA CTTTGCTCTG TTAAGCTCCG CCCCTCAATC 120
TACCCCCTGC AGAGAACGTG TTGGAGTTTT GTCGGCGCCA TTTTCTGCTC CCTCGTGCGT 180
ATAGGTAAGC TCTCTTGTTT AACGTCTTAA AACATCATTT TATCGATTTA TATGAGTAAA 240
TGTGCTAACA CAACGGTATA TGTTGTACTT TGATGCGTTT TGTTTGTTAA AACATTGATT 300
ATGAGTCACT TTGTGACCGT GTCATTCCAT CGATTTTATC ACAGTGTGGT CACCTTAACG 360
TTAAAGATAA AGCTTAAACG ATGCCAATGA TCTTACTTAA ATTGTTTTTG CGATTTCTAA 420
TCTTACTTTT ATATCCATTT AGTTTTGTAC TGTGAACTCT CTGAAGAAGA CGGTAACGTT 480
AGGCTACATT TAGCCTCGAA GTTTTGCTTT CAAGAGCAAC TGCAATGCTC CAGGTAACTG 540
TTAGGTCAGT ATTTTGTTGT TTCAACATAT TAAGATGGTA ACTTACAGAG AAAGTTATAT 600
GATATGAACA TATGTAGCGT AAAATTAACT GTGTCTGTAT GGCTGTCGAG CTCACTGCTG 660
GTTAAATATT TTCAGTCCAT TTCAAATTAC TTCCTAATTA ACGTTTCTCT GTTAAGAGGT 720
TGCATTTTAA CAGCTTGTTA GTGTTGTCAT GATACTGTTT TTCGGTAACA GTTAACTGAA 780
ATTCGCTGTT GAGCGCGGTC CTAAACCCCG CCGTTTGGCC GTGAAGGTCA CCAGTTCACC 840
GCACTTAACC GCTGTTTACC GAGTGCAAAC ACCGATACAG AGACAGCGGA TCATTTTAAA 900
ACTGTGAATC ATCAGCGGAT CTCTTAAATG TCAGCCCATA GACACGCCAG CTCATCTTCG 960
CGGCTTTTAA AACGATCAAG TGGCGTGCAT CTGTGTTTGT GCCCGGTAAA CAGCGGTGAC 1020
ATGTAGTGAT GGGTCGTTCA TAAACGATTC GTTCATTTTG AATCAATCTT TTGTATGACT 1080
CGAAAACGTT GAGTCCTTTC GGAGTGATTC GTTTAATTGC GCACGCGCAC AATTGTGCTG 1140
GTGGAGCAGA AGATTCGTTC CTTTTCGAGT CTTCTATGTG CTTTGAGTCG TTCGTTCATC 1200
GCGTGAAAGA CAGAAGCCAG TCATGCATTT AGAGCCGGAA AATGTTTTGA TTCGTTCATT 1260
TCTCGAGTCT TCGGATTTTA TTCATCTCTC TTCACGTGCT GCCACATGAT AAACGAACGA 1320
CTCAAAAACC AGAAGACTCA AGAGGTAAAC TAAAATCATG GCTCCTTTTG GCAGCTTAAT 1380
TAATATGGGT CTGTGTGACG TGAACGAACC ACTGACGTTT GAAGAGCTGA AGCTGATAAT 1440
CATAGACAAA AGACCAGGTA AACAATAAAT GATGATTTAC TCTTATAGCT TTCCAAGTTA 1500
TGACTATTTT GTGTAATGTG GCAACGTCTG TGCTAGTTGT AGATGAGTTT GGAAGCAACT 1560
TATTACATTT TAATAATATT TTGGCTACTC AAAAACACTT AAATATTAGC GGAAATGGAT 1620
GCTTTTAATT CCAGTACCAA TTGGTACCAA TATTCAGTAT CATGACAACC CTTCAGCACA 1680
GACATTATTT CA 1692