EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-04808 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr12:28621440-28622339 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF2MA0051.1chr12:28621636-28621654GTTTTAGTTTCCTTTTCC-6.19
IRF3MA1418.1chr12:28621634-28621655AAGTTTTAGTTTCCTTTTCCG-7.09
Lhx3MA0135.1chr12:28621501-28621514TAATTAATTAATA+6.25
Lhx3MA0135.1chr12:28621497-28621510TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr12:28621494-28621507AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr12:28621498-28621511AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr12:28621493-28621506AAATTAATTAATT+6.92
POU6F1MA0628.1chr12:28621495-28621505ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr12:28621499-28621509ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr12:28621503-28621513ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr12:28621495-28621505ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr12:28621499-28621509ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr12:28621503-28621513ATTAATTAAT-6.02
ZNF384MA1125.1chr12:28621705-28621717TCAAAAAAAAAA+6.11
Enhancer Sequence
CGGTTCATTC CGCTGTGGCA GCCCCTGGTG AATAAAGGGT CTAAGTCGAA GGAAAATTAA 60
TTAATTAATT AATAATGCGC ATGCATGCAA TAGATACAAC ATTTATAATA TTAAATTTAA 120
ATAATATATA AGGGATTTAT AAAAATAAGA ATGATGTTTC AAAAAGTTAT ATGAACGCCT 180
GAAAAATGTC TGGAAAGTTT TAGTTTCCTT TTCCGTAAAA TCTAAATCAA TATATTTTTT 240
ACGTGAATGA AACTTCATCA TTGCATCAAA AAAAAAATTA ATGATTCTAT CTGCCTACAA 300
GAGGTTGTAT TATTACTCAA ATCACCCAGT CTTTCTCGCT ATCCTTCTCA GCATTACCCC 360
ACACATTGCC CCAGCAACAA TCCCCTTCTG CTCTATAAGC GTTGATGTCT TTTTCCACAC 420
CATCTCTCCG TCCCGTTTTC CTCCCTCCCC TCGTGGATTA AGATACAAAA CTCCAGCTCA 480
TATTGCCCTG TTACACAGCT CATCCGCAAA AGGTAGCTTT AATGGGGTTC CGCAGTGATT 540
TATGCCTGCC CCAACAAACC AACGCAAATG AGACTCGACA CTGGCCCACA TACTTTTTCC 600
AGGCTTCGAG CCAACAGATA CAGACAGAGA CGCGCGCTAT TGCTCATTCA TGATTTCAGT 660
CAGAGGAGTC GCGGTGCGCT TTTTAACATC TTTAAGAGTC AGCTTTCTCC AAGTGTCCCG 720
AGAGGCTGCT GATTCCACAT TACATCCCGT GACCCCTGTG TGACAGTCGA CATGACAGTG 780
GTGATGATTT CTTAATGTCC GCCAAGTGGG CGTCGGCGGG GGTCCCGATT CTGACATTCA 840
GGAGTGATGA ACGTCCTGTG GCCAATAAGT GGAAGCCGTG TTTTGGAGGC CCGCGGAGC 899