EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-04488 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr12:16944536-16946664 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LHX2MA0700.1chr12:16945063-16945073ACTAATTAAC+6.02
Lhx3MA0135.1chr12:16945050-16945063TGTTAATTAATTT-6.19
POU4F3MA0791.1chr12:16945705-16945721ATCATGAATAATTCAA-6.14
RARA(var.2)MA0730.1chr12:16945667-16945684AGGTCACCGTAAGCTCA+6.02
Rarb(var.2)MA0858.1chr12:16945667-16945684AGGTCACCGTAAGCTCA+6.56
ZNF24MA1124.1chr12:16944926-16944939AAATGAATGAATG-7.34
Enhancer Sequence
GTAAACTAAA CATTACTTTA TTATAAATTC ATGATGGCGA CGTGGTGGCG CAGTAGTGCT 60
GTTGAATCAC AGCAAGAAGG TCGCTGGTTT GAGCCTCGGC TGGGTCAGTT GGTATTTCTG 120
TGTGGAGTTC TGTGTGCATG TTCTCCCCGC GTTCGCTTGG GTTTTCTCCG GGTGCTCCGG 180
TTTCCCCCAT AGTTCAAACA CATGCGGTTC AGTTGAATTG GGTAGGCTAA ATTGTTCGTA 240
GTGTATGAGC GTGAATGAGT GTAAATGGAT GTTTCCCAGA GATGCATTGC AGCTGGAAGG 300
GCATCTGCTG CGTAGAACAT ATGCTAGATA AGTTGGCGGT TCATTCTGTT GTAGCGACCA 360
CAGATTAATA AAGGGAGTAA GCCGACAAGA AAATGAATGA ATGATTTTAT GATAAGGTAA 420
TGCATGCAAT TATCATGAAC TAACGTAACT ACAACATGAG TCACATGAGT TCATGTGTGA 480
ATAACAGCTA CCTTAATTAC TTGTTAGTAC ATGCTGTTAA TTAATTTACT AATTAACATT 540
TAAGTTTAGG CTAAATGTAA CTAACGTGAA CTTGTGAGTT GTTAATGTAT AATTATGTCA 600
TGACTTGGAG GGGCACATCA CCATTAACTC ATCATTACCT ACTCATGAAT TCCTGTTCAT 660
GTTGATGCTG CCAGAACACT TTACTATTGT TATTCAGTGT AAAAATACTA GATGGACGTC 720
CATAGGAAGT TCATGAGTAG TTAAGAATGG ATTAATGATG ATGTGCCCTT CCATGAAAAG 780
TCACAATATA ATTATACATT AACATATCAC GAGTTATGAT GGTTAAATTA GACATAAACA 840
TGTACTAACA ATTAAGGTAG CCGTTATTCA CACATGAACT CATGTGACTC ATGCTTAAAG 900
TTAATTCATG ATTGGCATGC ATTAACTCAT CATTAGTTAA TAATAAAGTA ATGTTTAGTT 960
TACATATTAA TACATCATTA TTCATGCTGT TATTGTAAAG TGTTACCCAT GATGAACGAC 1020
ATTAAACAGC AGCAAAACTC TGTTACTTTG TATTTTGCTG CTTTCGGTTT GTATTTCTTA 1080
ACGCACTTCC GCGTGCGTTA CTCTCCCGTC ATGATCTTGG ATGATGAGGT AAGGTCACCG 1140
TAAGCTCAGC GTAGTGCTTT GGTCACTGAA TCATGAATAA TTCAAGTAAA ACGTAGCTGT 1200
GGTGTCACGA TGATTGTGTC TGTCGTAACA GCTCGTAATA CTTCTCGTGA ATATTAATGT 1260
GGTGATGCGA GCTATCGTTT CGTTACACAA TGGCTACGTT GAGCCTACGT CATCTGCTCC 1320
ACTTCCTTTA AAGAAGCTCA ACATATTTGG CAGCGAGAAA TAAACTTACA AACCGTCCTT 1380
TTTAACACGA GCTCTGTTAA ACAGTCATGA AATGTCCGCT ATCCATACTG TTCTCTCATC 1440
ATAACTTTTT AGCTCTGAAA AAACGATTTC TTGTCAAAAT AAAAGTCCCC CATAAACAAT 1500
AGAAATAAAG TGATCCTTAA ACATGAAGAA ATGTAAGATA ACTCTTATTA ACGTCTGTTA 1560
CAGTGTTAAT TAATAAATTA GTTAACACCT TAGTGCTTAC AAGAACCATT AATGAACAAA 1620
TGTAACATTA GATAATGCTG AGTGTACACT ACAATAAGGT TATTAATTAC ACTAACAAAT 1680
GCTTTGTTAA TGGTAAATCA TATTAATAAA TGGTTAACAA ACATGAAAAA CATGTAAGCT 1740
GAAGCTTACA TCTCAAACAA CATCTCAAAC AAACACGTTC TGTCTTGGTC ACAGATGCGC 1800
CAGCGAGACG CGCACCAACA GTTTATCCTC TTTTTTAACT ATGTGTCACT CATTATGTTG 1860
TGTGCACAGC AATACTTTTG GATAAAAATG TGCTACTAAA CCTTCACAGT CTGCTCTTAC 1920
TGCTGGAATC TGCAGTCAAT GAAGATTCGT CACCAAGGAG ATATGAGTCG TCTCGCGCAT 1980
GCACTCTGTC TCTCTCTCTC TTTTTGCTTG ATTTTCATTT TGACAATGCT GAGATTGCAT 2040
GCATCAGAGT TTTTCACCTT CGTGAGAAAT TAAACCCCAG ACTAACACAG GTAATGAAAA 2100
ATTCAACTTT AGTCATTTTC TATTTGGA 2128