EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-04437 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr12:15469476-15470421 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxq1MA0040.1chr12:15469535-15469546AATAAACAATT-6.02
Gfi1bMA0483.1chr12:15470085-15470096AGCTGTGATTT-6.14
IRF1MA0050.2chr12:15470334-15470355AGTCACTTTTACTTTCACTTT+7.93
JUNMA0488.1chr12:15470021-15470034ATGATGATGTCAC+6.06
POU1F1MA0784.1chr12:15469617-15469631AATATGTAAATTAG+7.28
POU2F1MA0785.1chr12:15469617-15469629AATATGTAAATT+6.02
POU3F1MA0786.1chr12:15469618-15469630ATATGTAAATTA+6.02
POU3F2MA0787.1chr12:15469618-15469630ATATGTAAATTA+6.02
POU3F3MA0788.1chr12:15469617-15469630AATATGTAAATTA+6.22
Enhancer Sequence
CCCTTTATCT ACACCACAAG AAAATAATAA AACAACAACA ATAGAATAGA ATAAAGAAGA 60
ATAAACAATT CAAAAGGAAA TCCCACTAAA TGAAGATTTA CTCTTTCAGT CAAAATTTAG 120
CACCTTAATT CTTCAAAATA AAATATGTAA ATTAGCCTTA CAAGTCTAAC TGTTGTTCTT 180
TACTGACTTC CTTTGTTCTA AATTTCTTAT GTTTCCTTAC ATTTTGTTTT ACCTCAAATC 240
AACAGATGAG ATAAAAATCA CATTAAAGCT AAAGTTAAAC GCTTCTGAAA TAACACCTCT 300
AAACACTATT AACTCAGATC GTTTCACAAT TGTAAACAAA AAATGAATAA AGTGAACCTC 360
CAAATCTTTA CAATTTAAAT GGTCTCAGTC TAGTTCACAA ACTTATTATA AATCAGTCAC 420
AGTCAAAACA GTCACAAAGT CACTCAGTCA AAAAAAAACA TTAGTATGCA TACTTTAACG 480
TTGGGGCCCA GTTCGTTGGT GCACATTCGC AGTTGTATTG TTTCAGAACG ATCTCTCAAA 540
ATGCAATGAT GATGTCACTT ACGTCCATCC GATGAAAGCC AAACATATAA TGAAATCCCT 600
CCTGCACAAA GCTGTGATTT ACCGCTGTCC CACGCGATAA TTCCACGTCC AGCGCTGAAA 660
CAGGTCTGTC CAGTTCAGAG CAGCATCACC ACCAACTCAA TCAGCACAGT CACTGTTCAC 720
TCAGGTAAAT GTCATTAGCG TTAGCGGCTA TGCTACGAGC ATGGTGTCCT CAGCTGAGAG 780
CATACACTCG TGTGATACAC GACGATCGCA AAGCGAAAAC TCCACAGAGA GAAAAGCAAA 840
TAAAACGAGC TGAGTCCCAG TCACTTTTAC TTTCACTTTG AAGACTTAAT ATTACCAATA 900
TATCGCCTCC CAACTATGAA AACACATAGG ATGATCTGCT GCTGC 945