EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-04304 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr12:12008211-12009219 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr12:12009148-12009165GGCTATTAATTAGTTCA-6.07
IRF1MA0050.2chr12:12008857-12008878AATAGGTTTCGTTTTCTTTTT+6.19
IRF9MA0653.1chr12:12008861-12008876GGTTTCGTTTTCTTT-6.02
MEF2AMA0052.3chr12:12009068-12009080GCTAAAAATAGC+6.44
MEF2BMA0660.1chr12:12009068-12009080GCTAAAAATAGC+6.92
MEF2CMA0497.1chr12:12009066-12009081CAGCTAAAAATAGCT+6.56
MEF2DMA0773.1chr12:12009068-12009080GCTAAAAATAGC+6.22
ZNF384MA1125.1chr12:12008770-12008782AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr12:12008769-12008781TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr12:12008768-12008780TTAAAAAAAAAA+6.44
Enhancer Sequence
CAAACAAAGG GATGTTTCTG TGCTTGGATG TACGAGTTAT ACCACTTCAT CATTAACGTT 60
ATCCATCACA CATATTCAGT CGCGTCTGGT CAGATTTATT TGTCATTACA GCAATACAAA 120
ACACTCAATA ACGTAACGGC AACACTGGAA TAAACCTTCA AAACGGCATA GAGAAAAGAC 180
AAATAGCATA TAAAACAAAT AAATGAGTTA ATTAAATATC TCTCGCATTT TCATAAGTTT 240
AACTTTAAGT TTCATAGGGA CTGTTAGCAT AAGCACACTT TAGCATCATG TGTAAATATG 300
TATCTGCCTC ATACAGTGAC ACGAATCGTA ATCGCATCGA AATCCTAAAT TACCTACAGT 360
ACGACACTCA CGGGTCCATT TTGAGCTGAA ACTGCTTTAT AATGTTCTAA AAGCCTCGGC 420
GGGTTAAAAC TGCTGCTGCC CCGGCGATCA TGGAGAAAAA AACGACTGGT CTGGTCATGA 480
GCCGCTCGCT GACGCCGGAC CGAATCACAG CTGATCTCCT CACCTGCTTC CTGCAGGTGA 540
TCTCATAAAA GTAAATCTTA AAAAAAAAAA ACACGCATAT TTTCGTCACA AAAAGCGCCA 600
CTAAAGTTCA GCGATAACTA ACGTTACTGT ATTTGTAATG CGGATAAATA GGTTTCGTTT 660
TCTTTTTTAA AAATGTAGAC CTACAGCTAT GTGTTGGTGT TAACTTTACA TCTATTTGAA 720
CGGATCATTG CGCGCGCTCT TGCTCTCTCA GTGCATCATT TAAAATGGCG CGGCCCGCTC 780
TTTTAGAGCA TAACGCCCAC TTTACAAATT ACTACTAACT TTACAAATTA TTAATAGTTA 840
TTAAAAAGGA CTAAGCAGCT AAAAATAGCT TATCTAGTAA AGTAGACAGT ATTGCAAATA 900
ACGTGCAGTG GTCAAAACGT TTAGTCACAA CATCATGGGC TATTAATTAG TTCACAAAAC 960
AGCAAACAAT TTCACAAAGT GCAGGAAATA AACAGATTAA TGATACTA 1008