EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-04300 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr12:11611547-11612670 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CrxMA0467.1chr12:11612247-11612258CTAATCCTCTT-6.62
Gmeb1MA0615.1chr12:11611767-11611784TCGTCTTACGTACGCTC-6.83
HOXA13MA0650.2chr12:11611747-11611758ACCAATAAAAC+6.32
HOXB13MA0901.2chr12:11611747-11611758ACCAATAAAAC+6.32
ONECUT1MA0679.1chr12:11612555-11612569AGTATTGATTTTTT-7.19
ONECUT2MA0756.1chr12:11612555-11612569AGTATTGATTTTTT-6.93
ONECUT3MA0757.1chr12:11612555-11612569AGTATTGATTTTTT-7.14
Enhancer Sequence
CTCTTGTTAC AAGGCAGTTT CGTATTAACC AGATATTTTT CTTGAATATA TTCTAGCTGA 60
ACGACGTGCA TGTAAATTAT TTTTAAATAA TATGACGTTA AATTCCTTAA CATTAAATTG 120
ACATTTGCCT ACATTACCCA TAGTTCATTA TGAATAACGC CCGCCCACCG TGTTCAAGTT 180
CAACGCTCTT TCAAAGACTG ACCAATAAAA CGCGTTGAAA TCGTCTTACG TACGCTCAGC 240
GCGTTCGGTG ATTGGTCAAC ATGGTTATGC CTGTACCGCG ACGCGATTGT CGTGATGCGA 300
AAACGCGAGG GAGGGGGATC ACGAATGGAG GCCGTTGGTG TTTCAGAGTC GAAACAATCG 360
AAGGGGAAAC AAATAAGAAA AACTTAAACA AAAAGCCTGC TGTTTTGTCT CTTTCGTTAT 420
ATTAAATCTC ATATTTCAGA TACACGTTAA ACTGTGTGGG CGGAGTTCGC GAAACAGTCC 480
TTGTCAGTAT TTAGTGTTTG TTTATAGTGT TAGTGGAGCT CTGAGGCCCG GATTCACTCT 540
CTTCACCAAC CAGGCGAGTA TTTAACATCT TTTGGTCCTG CTGTGGGATT CATTCTTTCC 600
TGGATTCAAT ATGCACACTG CTACCTGATA TTAAATGAGA ATTGATACTG GAAGTGATGT 660
GTGTTAAACA TTGCCTTATT AGCCTGCTAG CGTCTTCATG CTAATCCTCT TGCTAGTCTT 720
TTAGCTGTTA GCATTGATGT GTTGTTGTTG TCAACCGGGC ATCATTTCAT CCCCTCTTTT 780
GTTTAAATCT AAATGAATAA GTTGTATCAA TGTGCTGTTT GCTTGGCGGA TGAAAAAAAG 840
TAGTAGAATG TACGTGTTTA TCAAACAATG AACGTAAATA AGTAGCATTA GCGTGTTATC 900
ATATTAGCTT TTAGCAATCT CAGTTTACTG TTGATTATTG AGGGGAAAGT CGCTGTGTTT 960
TCAATATTAC TGAATGCAAT TGTAGCATAT TTGTTCTTAA TGTTTTGTAG TATTGATTTT 1020
TTTACTCTCT AGAATGGAAG CTAATAACGA TCTTTACTTG TGATGGTAAT ATCTTTATGA 1080
ATGATTGCCA TGTTAGTATG TCATTGTATT TACTTAGTAC CCC 1123