EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-04243 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr12:9094760-9095603 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr12:9095318-9095335GGATTTAATTAATTATT+6.18
DBPMA0639.1chr12:9095128-9095140CATTACGTAATA+6.18
HLFMA0043.2chr12:9095128-9095140CATTACGTAATA+6.11
KLF5MA0599.1chr12:9094996-9095006GGGGCGGGGC-6.02
LMX1BMA0703.2chr12:9095319-9095330GATTTAATTAA+6.02
Lhx3MA0135.1chr12:9095323-9095336TAATTAATTATTT+6.71
Lhx3MA0135.1chr12:9095320-9095333ATTTAATTAATTA-6
SP1MA0079.4chr12:9094994-9095009AAGGGGCGGGGCTTA-6.51
SP2MA0516.2chr12:9094993-9095010TAAGGGGCGGGGCTTAT-7.61
SP4MA0685.1chr12:9094992-9095009TTAAGGGGCGGGGCTTA-6.57
TEFMA0843.1chr12:9095128-9095140CATTACGTAATA+6.22
Enhancer Sequence
ATAATTAAAA GAATATCATG TACATACCAC AAAGACAAAG CCAGCAAAGT ATATGAGCTG 60
TGAAGGCAGG ACACGGCATG ATTACTCTGC GTTATGGTTA CATGTCTGGC GAACGACATG 120
CCAAAAGATA AACTTGAGTT CCGCCCAAGT GGGCTGCATT TCACTTTATC AGGACAAACC 180
CAGAAAACTG AAAATATACG AAGAACGGCT TTCAGCGTGA GACTGAAGTG AATTAAGGGG 240
CGGGGCTTAT TTGCGTCATG TAGAAGCGAA ATAATAATAC TCAAAATTTG ACAATTGTTA 300
CTGTTTCATA ATACCTCCAA GTTAAAGCAC GGTTACTCAC AGACATTCTA AAGATATAAA 360
TCATTATCCA TTACGTAATA AAAAAATATT CCAGAGAAAG TATGTCACGC GGCTAGTAAT 420
ACCTTTCTCA GCGCTGAACG CGATGGACCA ATCACGTTCA CTTCTGATTA CTCAATAAAG 480
TGCGTTTGAT ATACTTTATT AGTGATTTGT TGGACGGGTG TTCATTTTCG TGTTAAATTA 540
CAGTCTTTTA AACTTATTGG ATTTAATTAA TTATTTGTTT GGCGTTTTAA ACACTAAATG 600
ATATTTAAAT GGAGCTCAAT GAAGAAATGG GTGATGTGGG CCTCCCTCTG GTTGGCTCAT 660
CGCACCGCTA CCCTTTTGTG GGACAGTCAC AGACCGCAAC ACATCCCGTA ACGGCAATGA 720
CTCATAATAT TACAGGAAAC ACTTATCATG CATTATTTCT TATGGTTAAC ACTTAGTTGT 780
AGCTTTTAAC CAGAAAACTT TTATTTTATC TTTAATTTTT TCAAAACCTT CAAACGGATG 840
TAT 843