EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-04239 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr12:8925289-8926572 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr12:8925512-8925523AATTTAATTAA+6.32
POU3F1MA0786.1chr12:8925516-8925528TAATTAACATAA-6.04
POU3F2MA0787.1chr12:8925516-8925528TAATTAACATAA-6.07
PRDM1MA0508.2chr12:8925764-8925774TCACTTTCAC+6.02
RARA(var.2)MA0730.1chr12:8926000-8926017AGTTCACTAAAGGGTCA+6.32
Enhancer Sequence
TTTCAAAATA GCCTGTTTTA AAGAAAGTAA GTTTATTATA GAAAATATAG GCTATGCAAA 60
ATAATATATA AACAAAACTA CAAACCTACC GTGGGCTCAC ATAAGACATA AAAGAAGTGT 120
TATTTTTGCC TCCTCAGGCG AACACGACTT GCACTCCAAA CAATGCAGGA TTGTTCCGAC 180
GCAAATTTGG GTGAAATGTG GACAAACCTA AGTTTGGGTT CAAAATTTAA TTAACATAAC 240
TGTTGGGGTT GTCCATATTT TACTCAGATT TAGCTCAGTC CTTTATTTAG TGCGCAATGA 300
CATGTAATTT CTAACTTTGG TGGTGACTAA AATGCAAAAA AATAGTCAAG AGTCTTTATT 360
TAGCAGCACA CCCCTTCCCC ACATAATTCG CACCCCCATA AAAAGAAACA TTTTGATTAC 420
AATCTTTGAA AATATCTCTA CCCTCTGAGG AAAGGAAATA TATACCCTAT TATCATCACT 480
TTCACAGCAT ATAACTATAT AATCTTTACC TTAGATGGCG TGTCTCTGCA GCCCGCTGGA 540
GCTACTGGCT GTTGTTGTTT ACTTGCATAA AATGACTCGC ATTAGTGACA CGTGGCACAG 600
CTATAGGTAG TGAATTTGTC TTTGATTTAT GAGTTTACAT GACATATAGA CCCGCGAACG 660
CAGTTTGAAC CGTGAGCACC GCAGGAGGGG GTCACGAGAG CACAGCCAAA CAGTTCACTA 720
AAGGGTCAGA CTGAAGACTC GGATTTGAAG CCGTGTAACC TGCAGTCTCT GGAGCCTCAT 780
TCCGCCTTTT ATTTGCATTT AAAAATACTG TTGCTATTAA AGGCTCCGAC TTTCCTGGCC 840
AAAGCAAACT AAACGATCAG ATAGTGGAAT ATAAACGGGT TTAACCGTGT CAGCGTAGGT 900
TGTATAATTA ATGCCTTTTG AAGATAGCTT ATGTGTAAAT GAGTGTTTCT ATAGGGTTTT 960
GTTATTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTTT GTTTTAGAAA 1020
TACAAAATAT TAAGCACTTA AACTTAATTA CTTAACTAAA TGTATTGGCT GAGCTTACTA 1080
GTGTTTGTCA TGGTGTAAAC TTGTAGTTCA TTTAGATTTT ATTCAGTACT ATTATTCTAC 1140
AATGTAATTC TGTGCATATG CATCTCTTTT TAAATCAGTT TATAACACAA ATAAGGACTG 1200
GATTTAACTA ATAACTGAGG CAAGCAGCCG CTTAGGGCTT CTGGAAATTT CAGGGCCCCC 1260
AATAAATACC TAGACGTATA AAT 1283