EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-04234 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr12:8683155-8684403 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ATOH1(var.2)MA1467.1chr12:8683912-8683922AACAGCTGTC+6.02
HNF1AMA0046.2chr12:8684366-8684381AGCTAATCATTAATT-6.59
HNF1BMA0153.2chr12:8684367-8684380GCTAATCATTAAT+6.18
TFAP4MA0691.1chr12:8684163-8684173ATCAGCTGTT-6.02
Enhancer Sequence
ACCACCCCTT TAAAAGATTC CCTAAAGATT AGAAAGTTCA AAAGATTAGC ATTTATTTAA 60
AAGGGACTTA TAATACCCAT TTCTATAAGA TGTCAAATAA GTCCCTAGAG TGTGTAAAGT 120
TTCAGCTCAA AATGTCACAC AAATAAACTC TGCAAAACTG CCTTTTTTAG GCTGTGATCC 180
CAATCATGCC GTTTTGGTGA CTGTCACTTT AAATTCAACA CAATATACAT AACAATATTC 240
CACACAACAT CATAAATGAC ACAATAGCAA TTGTCAGTTA TGTTCAGAGA CTGACAGGAC 300
TGAAAGTAAA AACTTGTGGT TCAGACAGTG AGTCAAATTT AAACCAGAGT CGTTAGACCG 360
GTACAAAACA ATAACTCGAA TGTTAGAAAA TGATTCGTCA GTCTTTACGG CTGACTCATC 420
TAGAGGAAAA ACAAAATCGT TCACAAAATA GACTAAACTG CTCACACACC ACATGTTTGA 480
GGAGAGAAAC CGGCCCAAGT CACATTCAGC TGAAAGATCT GCTGTGCTCA ATCTGAACAT 540
TGGAGAAAAC AATCAGCTAA GCTGGAGCTG AAGCACATAT ATCAACAGAC CTACAGAAGA 600
AAGGCCAAAG TGTGCTGCGA AAACAGTGCT GAGTAAGGAT ATCTGCTTGG CAATAAACTC 660
TCCTCCAATG GCAGCCATAA ATAATAGAGC CGTGAAGGCA ATTGTGTGCA AGCGAGGGAC 720
ACGGGAAACT TAAAAGAGGG AAAGACGACA GCAAAATAAC AGCTGTCAAA GGGAGACTAG 780
AGAACAGCAC AATCACGCGA GACGTGTGGG TAAATTGCTG TTTGGTCAGG CGTAGAGTCA 840
CATAATTAGG TTATTAAGTT GTTTGACAAC TGTAAAAAAG CCGGAGTGAA AATAGTGTAA 900
AGAACGAAAA CCAAATCAAT GAAAAATAAT TGCTGCTTTA AAAAAATAGC ACAATAATAT 960
AAGAATCATT TTTATAAAGC ACAATGCATG CTTGTGTTTT CTCTGAAAAT CAGCTGTTGT 1020
CAACAGTCTA TTAACTATAT CATATCTCGC TCTAGTTAAA TCCTTCTGAA AACGAGTGGA 1080
GCATAACAAA AACAACAGAT AATTCAACTA CAGGGTGCTG ATTAGGTCTA TCTGTGCTAA 1140
AATATACATT ATGGTAAGAG CTATGACTAG GCCCACACGG AATCTGCGCG CACAGAATTC 1200
TGCAGATTTT TAGCTAATCA TTAATTCTGT TTATTTCGAC TTGTAATA 1248