EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-04172 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr12:5205363-5206531 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr12:5205380-5205392AAACAAACAAAC-6.32
Foxj3MA0851.1chr12:5205373-5205390AAAAAATAAACAAACAA+7
HAND2MA1492.1chr12:5206123-5206133TGCAGGTGTT-6.02
HES6MA1493.1chr12:5205750-5205760GGCACGTGTT+6.02
SIX1MA1118.1chr12:5206378-5206389GTAACCTGATC+6.14
SIX2MA1119.1chr12:5206374-5206390CTCTGTAACCTGATCT+6.89
ZNF24MA1124.1chr12:5205891-5205904AAATGAATGAAAG-6.09
ZNF384MA1125.1chr12:5205367-5205379TCAAAAAAAAAA+6.11
ZNF384MA1125.1chr12:5205365-5205377TTTCAAAAAAAA+6.18
Enhancer Sequence
TATTTCAAAA AAAAAATAAA CAAACAAACA AATCGTTGTA TTATTTGTAT GGTGTGCCCG 60
TGTAATATCC GAAAGAAAAT GTAAGTTTTC TTCTGTGACA GTAGTGAAGT ATGTCAGTGA 120
GACTGAACAG TGAGTTAAAG TCCTCAGACA TTCCTATGCA GTGACACCTC TGCAGTTCAG 180
CTATTGTGCT GCTCGGTGCT GTAGTGCTGC TGTGTTTGCT GCTGACTGAG TTTCCCGCGT 240
CGGACCAGCT GAAACTCAGT ACTGCTTTTA AACACTTTCT GCAGTTTAAA CTGAAGTCAT 300
TTTTTGAAAC CACAATGAAG TTTCATCCTG TTTCGCGCGT GAGACGATGA CTTTCTGTTG 360
CCGCGGTAAG TTGCTTCTCC AATCTTTGGC ACGTGTTTAC GTTATGTTTG TATTGTGAAC 420
TCTCCTGTTT ATCCGTTCAT TTAGCAAACA TCCTGCAGTT GAACGTCAAA ATAACATTTC 480
ATGAAGCGTG TCAATTGATA AATTATGCTG TCGGATGATT TCAATTGGAA ATGAATGAAA 540
GAAAGACGAT GTGCTTCATA ACTCGTTTGT TTTCACTCAA CTCAGTAGCT TTAGTTCGGT 600
TATATTAGCC TAATATCTTA GTATCGTTAA CATACTACAA ACAATATTAT TTCATTAACA 660
CGATGTCATG ATGGTACAGT GTTTGGGACA TGACCAAAAA AACACGGTAA TACCATAGTA 720
AATTGTTTCT TTTTGTCAGT GATGGTTCTC AGTAATGTCA TGCAGGTGTT TTCGTATTGA 780
TGGTTTTAAG TTGTGCGTTA CATATCAAGA TTCATATTCA GTTTATTTAA AAATGTAAAA 840
AGAGGAAACA TTTAAGACTG TAAAGGGAAT TTACCGAAAA ACAGCGGGAC GTATTTCGGT 900
CCCCCCTTTT CTGCCTCTAC GGGCTCCCCA AGTCTCGTTT GGTAAATCTA CTTCTAATGG 960
AAATCTTATG CTGCTCTAGT AAAGTCTCTG TGCTGTGACT GAGCTGACCA GCTCTGTAAC 1020
CTGATCTTGC ACGAGTGATC CTGGGGTTTT TATGCTCAAA CTCATACAAT CCATTTTCAT 1080
TTACCAGCCT GGAAAATCTG AATAGATGGA AAACTTGTCT GATTTAGTTC ACATGCCATA 1140
TTGTTTTTAT GAGAACTCAA TGGAGAAA 1168